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bin1986

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】COMSIA用的活性数据类型不一样,结果差很远 已有5人参与

我建的COMSIA模型一个是用IC50做活性数据,得到的结果不错,r2达到0.9以上,但标准方差达到8.0多
但用pIC50做活性数据,得到的r2才有0.5-0.6,明显结果不太好。

我看人家文献上都是用pIC50做活性数据的,但我这里用pIC50做的r2不高

而我的IC50数据的标准方差达到8点多,文献上的都是0.几的。

现在选哪个都不是,请问大家怎么解决呢。

我的叠合应该没有问题的,模板构象是对接出来的,大部分分子都叠合上

另外我用的活性数据是细胞毒数据
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-05-23 10:22:02
IC50做活性数据,差别大否,最好是数量级的差别才行,如果差1,2倍就没有什么意义了。
除了你的亲人,没有人应该对你好,对你好的人,一定要珍惜。
3楼2010-05-23 09:32:04
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+2):谢谢 2010-05-22 17:29:41
一般情况下不会直接用浓度做应变量的,都会取负对数啥的。除非你的作用方式与别人的完全不一样……
2楼2010-05-22 17:01:57
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lanlanok

禁虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
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5楼2011-04-07 21:05:39
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zsj1012

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
那表达的不都是一样的结果
看的远,走的远
6楼2011-05-07 10:45:31
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