24小时热门版块排行榜    

查看: 946  |  回复: 3

emma82

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】如何在dmol中对不同的元素使用不同的基组 已有3人参与

请教高手们一个问题,如何在dmol中对不同的元素使用不同的基组,比如说对H,O使用全电子,对铅使用ECP.
是在electronic中直接对core treatment选择还是在input文件中写指令?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

天棚元帅

木虫 (著名写手)


emma82(金币+5): 2010-05-21 09:33:36
gavinliu7390(金币+1):谢谢交流! 2010-05-21 10:20:01
选择ECP,默认的就是轻的元素全电子,钪(Sc)之后是ECP
A man gets what he earns when he earns it.
2楼2010-05-20 17:15:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ym23

铁杆木虫 (著名写手)

dmol中对不同的元素使用不同的基组

★ ★
zzy870720z(金币+2):xiexie 2010-05-20 21:58:11
emma82(金币+5):谢谢了,很详细! 2010-05-21 09:34:01
◆        DMOL3里面可以采用不同的basis对同一个体系计算,如H2O,H原子采用DND,而O采用DNP,这时候需要关键词为:
Basis  value_keyword
                       min
                       dn
                       dnp
                       dnd
                       mixed
                       extended
                       all
                      user
mixed, extended, all and user. The customer can use their own basis by the ohther atomic programes.
   DND=6-31G+polarized orbitals;     DNP=6-31G+double polarized orbitals;
example:
For CH3OH
Basis      mixed
6         dnp
8        dnd
1            extended
如此定义basis后在对CH3OH计算的时候C,O和H采用三种不同的basis函数了,注意keywords里面只列出原子序数即可。
  
◆        Dmol3中plot脚本编辑主要用于计算结果输出内容的设置,如电子密度分布,差分密度分布(dmol3中称为deformation density), spin density, spin, electrostatic potential, homo, lumo,orbitals and e't'c
File format:
Plot                    value keyword
                           density
                           deformation
                           alpha_density
                           beta_density
                           spin
                           difference
                          potential
                          homo
                          lumo
                          orbital ###
                          fermi ###
                           off
example:
plot    density     potential
plot    orbital   7  8  9
plot    lumo
plot    homo
plot    fermi     1
这表示在计算结果中输出电子密度,静电势,分子轨道7,8和9,lumo,homo以及Fermi面形状。
博观约取、厚积薄发---壁立千仞、无欲则刚
3楼2010-05-20 18:54:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

emma82

金虫 (小有名气)

4楼2010-05-21 09:34:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 emma82 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见