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ottolzm木虫 (正式写手)
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【求助/交流】求助,各位大侠一个问题? 已有1人参与
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本人是做基因工程菌的,得到一段编码酶T的基因Sprt(文献报道),之后同数据库中的序列进行比对,发现在NCBI中有一株链霉菌A,其名称和实验室保留一株链霉菌B一模一样(只是编号差别),在链霉菌A中存在一段编码酶T的相似基因C(798bp,同Sprt相似度78.9%)及编码酶T相似蛋白酶的基因D(831bp,同Sprt相似度44.4%)。 之后我对实验室保留的链霉菌测定了酶T的活性(采用酶T的专一性底物),测到了酶活(酶学动力曲线很标准,一级反应动力学方程线性值为0.9998),随后我根据链霉菌A中的基因C和基因D设计引物,设想从实验室保存的链霉菌B中对C和D基因进行PCR,之前在论坛内请教了若干好心人,今天进行了PCR(DNA taq是BBI的DNA Taq 聚合酶),电泳之后发现PCR条带大小不对,本来是798bp和831bp,电泳条带却在1500bp处很亮。想请教大家,首先,一。我这样的思路是否有问题(因为在链霉菌B中存在一段酶基因TG,已经测序,当将其同链霉菌A的全基因组序列进行比对时,却没有相似的序列显示,而且推断的蛋白质中也没有TGase)? 二。如果出现了问题,是否引物有问题,或者是别的原因?三。如果换一种PCR聚合酶是否会对结果有所改变? 谢谢大家的无私帮助,谢谢大家!!! |
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ottolzm
木虫 (正式写手)
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