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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 基础理论 » 【请教】最小二乘平面的问题
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zhanghuaiy

铜虫 (正式写手)

[交流] 【请教】最小二乘平面的问题 已有4人参与

1，The chlorophenyl and hydroxyphenyl rings are each planar, the r.m.s. deviations from planarity for the two rings being 0.0012 and 0.0109 A , respectively.
2，The nitrone group formed by atoms C8, N8, C7 and C1 attached to two phenyl rings is nearly planar. Atoms N8, C8,C7 and C1 deviate from the least-squares plane by-0.008 (2), -0.013 (2), -0.017 (2) and -0.015 (2) A, respectivey.
这两句话怎么翻译? 第一句中的 r.m.s.怎么求算？-0.008 (2), -0.013 (2), -0.017 (2) and -0.015 (2) A数字又是怎么求算的？望各位大侠指点，不甚感谢！！！
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1楼 2010-05-18 16:01:45
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xflxy
2楼2010-05-18 16:06:41
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)
★ ★
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yanhualover(金币+1):谢谢交流 2010-05-19 00:12:54
在ins文件里输入MPLA n A1 A2 A3.....
n 是 你想要建立平面的原子个数，后面A1到An是原子名字。
比如说 你的C8，N8， C7，C1
MPLA 4 C8 N8 C7 C1 就可以了，shelxtl会给出这四个原子组成的平面还会给出这四个原子到该平面的距离。结果到LST文件里找。
如果你输入MPLA 3 C8 N8 C7 C1 那么shelxtl就是用C8 N8 C7 这三个原子建立平面，然后计算着四个原子到该平面的距离。
如果你输入
MPLA n1 A1 A2...
MPLA n2 B1 B2...
shelxtl除了给出这些距离外还会自动计算这两个平面的夹角。
结果在LST文件里。
我之前上传过一个ppt有关XRD解析和原理的应该对你有用

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1958392&fpage=1

[ Last edited by cluster8676 on 2010-5-19 at 00:10 ]
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学无止境
3楼2010-05-19 00:03:03
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)
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yanhualover(金币+1):谢谢交流 2010-05-19 07:45:02
第一句话是说，你的氯苯和羟基苯都是平面的结构，原子距离平面的有效距离分别是0.0012A和0.0109A。
第二句话说，你的C8 N8 C7 C1 组成的硝酮也是近乎平面结构的，然后给出这四个原子到该平面的距离~
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学无止境
4楼2010-05-19 00:14:34
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wsyy163

银虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yanhualover(金币+1):谢谢交流 2010-05-19 07:45:10
RMS 均方根(root mean square)

RMS＝（X1平方＋X2平方＋......＋Xn平方）/n 的1/2次方。




标准差(Standard Deviation) 也称均方差(mean square error)

MSE = （X1-X0的平方＋X2-X0的平方＋......＋Xn-X0的平方）/n 的1/2次方。
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5楼2010-05-19 00:14:54
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wsyy163

银虫 (正式写手)
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yanhualover(金币+1):谢谢交流 2010-05-19 07:45:16
Least-squares planes (x,y,z in crystal coordinates) and deviations from them
(* indicates atom used to define plane)
  2.3443 (0.0044) x + 7.4105 (0.0042) y - 0.0155 (0.0053) z = 1.9777 (0.0044)
*   -0.0743 (0.0008)  C7
*    0.0684 (0.0008)  C11
*   -0.0418 (0.0009)  C8
*   -0.0062 (0.0008)  C4
*    0.0538 (0.0008)  O3
     -0.0061 (0.0020)  O1
     -0.0980 (0.0028)  N6
     -0.0562 (0.0023)  C9
     -0.0314 (0.0030)  C10
Rms deviation of fitted atoms =   0.0546
  2.5438 (0.0040) x + 7.3488 (0.0040) y - 0.1657 (0.0042) z = 1.8626 (0.0026)
Angle to previous plane (with approximate esd) =  2.45 ( 0.07 )
*    0.0054 (0.0008)  C10
*    0.0082 (0.0008)  N6
*   -0.0052 (0.0012)  C9
*   -0.0337 (0.0012)  C8
*    0.0135 (0.0008)  C11
*    0.0118 (0.0009)  C4
      0.0568 (0.0019)  O1
      0.0214 (0.0018)  O3
     -0.1542 (0.0020)  C7
Rms deviation of fitted atoms =   0.0162
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6楼2010-05-19 00:31:01
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wsyy163

银虫 (正式写手)
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yanhualover(金币+2):谢谢交流 2010-05-19 07:45:26
这里就说明了怎样去读取lst文件
本来想翻译呢，结果cluster8676已经弄好了。就给您说说后面的内容
lst文件给出了相应的数据结果
*   -0.0743 (0.0008)  C7
*    0.0684 (0.0008)  C11
*   -0.0418 (0.0009)  C8
*   -0.0062 (0.0008)  C4
*    0.0538 (0.0008)  O3
     -0.0061 (0.0020)  O1
     -0.0980 (0.0028)  N6
     -0.0562 (0.0023)  C9
     -0.0314 (0.0030)  C10
中列出了构成一个平面的原子，及相对于最小而成平面的偏差 列在原子序号前面。但是列出这么一堆数据不足以说明到底这个平面性如何，那么就可用均方根偏差（r.m.s. deviation）来表示。您的第一个问题中的那两个数值就是这么来的。在我局举的这个例子中，由那些原子组成的平面方程是2.3443 (0.0044) x + 7.4105 (0.0042) y - 0.0155 (0.0053) z = 1.9777 (0.0044)，均方根偏差Rms deviation of fitted atoms =   0.0546。

当然例子中还给出了第二个平面的信息
2.5438 (0.0040) x + 7.3488 (0.0040) y - 0.1657 (0.0042) z = 1.8626 (0.0026)
Angle to previous plane (with approximate esd) =  2.45 ( 0.07 )
*    0.0054 (0.0008)  C10
*    0.0082 (0.0008)  N6
*   -0.0052 (0.0012)  C9
*   -0.0337 (0.0012)  C8
*    0.0135 (0.0008)  C11
*    0.0118 (0.0009)  C4
      0.0568 (0.0019)  O1
      0.0214 (0.0018)  O3
     -0.1542 (0.0020)  C7
Rms deviation of fitted atoms =   0.0162

Angle to previous plane (with approximate esd) =  2.45 ( 0.07 )这句话还告诉我们这个平面与前面的平面是有夹角的2.45（7）度。其他信息是一样的。



另外说明一句，这个例子来自shelx97 的说明书。希望大家还是先去看说明书。
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7楼2010-05-19 00:39:52
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zhanghuaiy

铜虫 (正式写手)
太感谢各位前辈！
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8楼2010-05-19 11:06:47
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zhanghuaiy

铜虫 (正式写手)
xp下的mean deviation from plane = 0.0059
与shelxtl下的 Rms deviation of fitted atoms =   0.0546有什么区别?还望各位前辈多多指点！
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9楼2010-05-19 11:57:44
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