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zwhgb

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】关于晶胞中取代一个原子的优化问题 已有11人参与

目标晶胞:MWW  MS中有自带

想取代其中一个Si为V原子,然后优化计算取代之后的晶胞参数。 但是我再取代原子的时候一次取代12个对称重复的原子,我只是想改变一个~ 用了display中的 default in-cell original 三种模式都不行,还是改一个会一起变12个或者10个。

如果能解决这个问题了

下面问下  如何优化整个晶胞?  我看到MS里面的Dmol和Castep都可以不知道优化结构出来,会算出优化后的晶胞参数?  

MS做的分子结构导入高斯能用的gjf好像不行。。。不知道如何转化坐标?

高斯里面的#T RHF/6-31G(d) FOpt  能不能优化晶胞 ?同样高斯得出优化结果会不会有晶胞参数?

最后一个问题,88个原子的晶胞用那个软件合适,单机PC计算时间大约多少?
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souledge

专家顾问 (著名写手)

zwhgb(金币+2):我要的配比是100:1的所以88个中取代一个是可以的,我试试castep 谢谢了 2010-05-18 15:28:09
有时候想改变一个,其实更重要的是看,自己想改变一个后的配比变为多少了。比如有个简单立方的格子,八个顶点有八个原子。现在想改变一个。也就是想要7:1的结构。但是一个格子其实只有一个原子(顶点原子被八个格子公用),那么,先要7:1,就需要八个格子做成超胞,然后替换体心的那一个,就可以达到7:1的目的了。但是这样会造成计算量特别大,有时普通PC承受不住……
周期性结构优化,传说DMol^3<高斯
思想重于技巧,内涵重于表象
5楼2010-05-18 14:17:16
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ym23

铁杆木虫 (著名写手)


zzy870720z(金币+1):谢谢 2010-05-17 11:17:42
zwhgb(金币+2): 2010-05-18 10:39:35
替代得在超胞下才行,super cell
优化晶格参数就选optimaze cell
高斯我没用过,
最后那个问题要看你的硬件如何,不是软件的问题。
博观约取、厚积薄发---壁立千仞、无欲则刚
2楼2010-05-17 11:00:33
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jphuang_63

至尊木虫 (正式写手)

问个好

zwhgb(金币+2): 2010-05-18 10:39:39
我在Fe超晶胞中用一个碳原子取代进行几何优化计算,在四核服务器上运算了11天才出结果,计算成本太大了!
互助学习,共同进步!
3楼2010-05-17 12:59:58
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ramble81

木虫 (小有名气)

zwhgb(金币+1): 2010-05-18 10:39:43
88个原子,估计pc够呛哈
4楼2010-05-18 08:52:34
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