24小时热门版块排行榜    

查看: 3768  |  回复: 14
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zwhgb

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】关于晶胞中取代一个原子的优化问题 已有11人参与

目标晶胞:MWW  MS中有自带

想取代其中一个Si为V原子,然后优化计算取代之后的晶胞参数。 但是我再取代原子的时候一次取代12个对称重复的原子,我只是想改变一个~ 用了display中的 default in-cell original 三种模式都不行,还是改一个会一起变12个或者10个。

如果能解决这个问题了

下面问下  如何优化整个晶胞?  我看到MS里面的Dmol和Castep都可以不知道优化结构出来,会算出优化后的晶胞参数?  

MS做的分子结构导入高斯能用的gjf好像不行。。。不知道如何转化坐标?

高斯里面的#T RHF/6-31G(d) FOpt  能不能优化晶胞 ?同样高斯得出优化结果会不会有晶胞参数?

最后一个问题,88个原子的晶胞用那个软件合适,单机PC计算时间大约多少?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jphuang_63

至尊木虫 (正式写手)

问个好

zwhgb(金币+2): 2010-05-18 10:39:39
我在Fe超晶胞中用一个碳原子取代进行几何优化计算,在四核服务器上运算了11天才出结果,计算成本太大了!
互助学习,共同进步!
3楼2010-05-17 12:59:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 15 个回答

ym23

铁杆木虫 (著名写手)


zzy870720z(金币+1):谢谢 2010-05-17 11:17:42
zwhgb(金币+2): 2010-05-18 10:39:35
替代得在超胞下才行,super cell
优化晶格参数就选optimaze cell
高斯我没用过,
最后那个问题要看你的硬件如何,不是软件的问题。
博观约取、厚积薄发---壁立千仞、无欲则刚
2楼2010-05-17 11:00:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ramble81

木虫 (小有名气)

zwhgb(金币+1): 2010-05-18 10:39:43
88个原子,估计pc够呛哈
4楼2010-05-18 08:52:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)

zwhgb(金币+2):我要的配比是100:1的所以88个中取代一个是可以的,我试试castep 谢谢了 2010-05-18 15:28:09
有时候想改变一个,其实更重要的是看,自己想改变一个后的配比变为多少了。比如有个简单立方的格子,八个顶点有八个原子。现在想改变一个。也就是想要7:1的结构。但是一个格子其实只有一个原子(顶点原子被八个格子公用),那么,先要7:1,就需要八个格子做成超胞,然后替换体心的那一个,就可以达到7:1的目的了。但是这样会造成计算量特别大,有时普通PC承受不住……
周期性结构优化,传说DMol^3<高斯
思想重于技巧,内涵重于表象
5楼2010-05-18 14:17:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 让我中一个面上吧! +12 大萍1987 2026-08-20 15/750 2026-08-23 20:44 by 大萍1987
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +4 process2012 2026-08-23 5/250 2026-08-23 19:58 by jurkat.1640
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +15 羊腰板 2026-08-21 16/800 2026-08-23 10:45 by process2012
[基金申请] 今天放榜吗? +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] 人气不行了 +8 fansofjerry 2026-08-21 8/400 2026-08-22 16:30 by zyqchem
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +10 kulium 2026-08-21 13/650 2026-08-21 21:58 by alongwaytogo
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +16 医学老男孩 2026-08-20 20/1000 2026-08-21 21:13 by Ldrop2023
[基金申请] 科研孤儿太难了 +17 我4大白菜 2026-08-20 18/900 2026-08-21 20:57 by zhangev
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
请填处理意见