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lmzhao

铜虫 (正式写手)

[交流] 【求助】软件构模问题 已有3人参与

我想用Gaussian中的ONIOM方法计算比较大的分子,如肽、蛋白质等,但是不知道用什么软件构建分子构形,发现用GaussView挺麻烦的,请高手推荐几款构建大分子的图形软件。非常感谢!
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sunhaitao

木虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
aylayl08(金币+2):谢谢交流 2010-05-17 10:48:11
一般有chemoffice ,gaussview,和molden等可以构建,我是用CHEM3D啊,操作起来比较顺手个人觉得!
一点一点进步!
2楼2010-05-12 18:49:02
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recoli

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
aylayl08(金币+2):谢谢交流 2010-05-17 10:48:17
For peptides you may want to use the built-in amino acid/nucleic acid fragments in GaussView.

For large proteins you may get coordinates from PDB.
3楼2010-05-12 19:04:56
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lmzhao

铜虫 (正式写手)

非常感谢!
4楼2010-05-15 10:14:49
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