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D.H.

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】用铜靶确定不含重原子的天然产物绝对构型的问题 已有6人参与

从植物中分离到几个天然产物,有3-5个手性中心,只有C、H、O,不含重原子。培养出单晶,但晶体较小且晶型不太好,用铜靶做了X单晶衍射。
    这几个化合物的精修前的 abs_structure_Flack    分别为0.1(2); 0.1(3) ;
-0.1(5) 等。
    问题: 1.用铜靶确定不含重原子的天然产物绝对构型时,Flack系数应该是多少?或者应该小于什么样的值,才能说绝对构型是正确的?
                2.一般化学类杂志和晶体学杂志对这个值的标准一样吗?Flack为多少才达到杂志的要求?
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erbao2828

金虫 (正式写手)

★
yanhualover(金币+1):谢谢交流 欢迎常来 2010-04-28 13:48
D.H.(金币+2): 2010-04-29 08:48
flack不是很好,但是有些杂志还是可以接受的.一般flack接近0就可确定绝对构型
2楼2010-04-28 13:24:26
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xiaochong98

木虫 (职业作家)

★
D.H.(金币+2): 2010-04-29 08:48
wsht212(金币+1):谢谢交流,希望常来! 2010-04-29 10:37
单从flack系数的数值判定不含重原子的分子的绝对构型没有意义,必须知道计算flack系数所使用的Fridel点对数。
北京人
3楼2010-04-28 14:57:29
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sigmax

银虫 (正式写手)

★
D.H.(金币+2): 2010-04-29 08:48
wsht212(金币+1):谢谢交流,希望常来! 2010-04-29 10:39
其实,你去做个偏振红外(VCD),就可能分辨出绝对构型。
4楼2010-04-29 00:26:35
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D.H.

木虫 (正式写手)

wsht212:谢谢交流,希望常来! 2010-04-29 10:37
现在打算做固体CD来确定绝对构型了
5楼2010-04-29 08:49:54
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erbao2828

金虫 (正式写手)

wsht212:谢谢交流,希望常来! 2010-04-29 10:37
引用回帖:
Originally posted by sigmax at 2010-04-29 00:26:35:
其实,你去做个偏振红外(VCD),就可能分辨出绝对构型。

固体CD不行,除非你有参照物
6楼2010-04-29 08:54:54
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

★
wsht212:谢谢交流,希望常来! 2010-04-29 10:37
帝夫(金币+1):谢谢交流 2010-05-03 22:31
要是FLACK为0(1)、0.2(2),是说明数据收的不好?还是晶体长的有问题?
7楼2010-04-29 09:29:24
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etongtong

铁杆木虫 (著名写手)

★
wsht212(金币+1):谢谢交流,希望常来! 2010-04-29 10:38
说明数据收的不好&晶体长的有问题
▄︻┻┳═一................................................
8楼2010-04-29 09:34:50
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

★ ★
wsht212(金币+1):谢谢交流,希望常来! 2010-04-29 21:17
帝夫(金币+1):谢谢交流 2010-05-03 22:31
数据不好?但解出的结构用户认为没问题。这类情况如何对用户交待?Mo时为0(1),Cu时为0.2(2),这该和收数据的关系不大吧?是不是晶体有点向孪晶方向发展?
9楼2010-04-29 16:55:23
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

wsht212:谢谢交流,希望常来! 2010-04-29 21:17
帝夫:谢谢交流 2010-05-03 22:31
顺便请教一下,实验室培养出的金红石能用单晶衍射测结构吗?实验室培养的黄铁矿呢?
10楼2010-04-29 17:00:53
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