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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】关于过渡态
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mikesnow

铁虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】关于过渡态 已有3人参与

大家好！
我最近在算过渡态的结构，我用QST3计算过渡态，
但是在计算的时候出现了下列错误提示：
Eigenvectors 1 and   4 swapped, overlap=  0.7733
                        Tangent   TS vect  // Eig F  Eigenval
       1  R1            0.02921  -0.01894  -0.00497   0.00715
       2  R2           -0.05807   0.03157   0.00032   0.00017
       3  R3            0.00508  -0.00019   0.00057   0.00229
       4  R4           -0.00908   0.00592  -0.00304  -0.00432
       5  R5           -0.01662   0.00357   0.00199   0.01135
       6  R6            0.00175  -0.00320   0.00148   0.01154
       7  R7            0.00347  -0.00045   0.00052   0.01492
       8  R8           -0.00330   0.00122   0.00089   0.01733
       9  R9            0.01038  -0.00725   0.00041   0.01748
      10  R10           0.01175  -0.00444   0.00011   0.01823
      11  R11          -0.01713   0.01619   0.00004   0.01848
      12  R12           0.00494  -0.01443   0.00046   0.01870
      13  R13          -0.00090  -0.00026  -0.00016   0.02020
      14  R14          -0.00003   0.00065   0.00047   0.02056
      15  R15           0.00087   0.00103  -0.00102   0.02600
      16  R16           0.42460  -0.30064   0.00003   0.02761
      17  R17          -0.00415   0.00461   0.00003   0.03034
      18  R18           0.04225  -0.02074   0.00142   0.03454
      19  R19          -0.07014   0.04034  -0.00032   0.03839
      20  R20           0.00440   0.00044  -0.00079   0.04135
      21  R21          -0.00847   0.00635   0.00026   0.04907
      22  R22          -0.00820   0.00229  -0.00005   0.05369
.............
     192  D100         -0.04732  -0.04266   0.000001000.00000
     193  D101         -0.03577  -0.02397   0.000001000.00000
     194  D102          0.15930  -0.19145   0.000001000.00000
RFO step:  Lambda0=9.694109392D-03 Lambda= 7.77505760D-04.
Inconsistency:  ModMin=   2 Eigenvalue= 1.73230458D-04.
Error termination via Lnk1e in /opt/g03/l103.exe at Fri Apr 23 09:49:48 2010.
Job cpu time:  0 days 16 hours 19 minutes 49.1 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=    106 Int=      0 D2E=      0 Chk=     10 Scr=      1
这是我的输出文件，有没有高手帮我看看？？谢谢谢谢！！！
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1楼 2010-04-26 16:34:36
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mikesnow

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by mikesnow at 2010-04-26 16:34:36:
大家好！
我最近在算过渡态的结构，我用QST3计算过渡态，
但是在计算的时候出现了下列错误提示：
Eigenvectors 1 and   4 swapped, overlap=  0.7733
                        Tangent   TS vect  // Eig F   ...

那我该如何修改我的输入文件呢？望高手指点！
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3楼2010-04-27 12:50:33
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superdirac

木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+1):谢谢 2010-04-26 21:38
这里说的都是分子动力学的！　
赞一下(2人) 回复此楼
我认为，酒一口一口喝，路一步一步走~步子迈大了，喀~容易扯着蛋
2楼2010-04-26 21:06:43
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xjiao

金虫 (初入文坛)

QST3求过渡态的问题

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
请教下大家，在用qst3求过渡态时出现下面的问题，这是什么原因呢？
Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.
(END)
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-03-08 19:45:39
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