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zhang668

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】做状态方程计算时候得到的EtVo.dat是空的 已有4人参与

下面是我按照侯博士教程写的脚本:
#!/bin/sh
for i in 7.846 7.946 8.046 8.146 8.246 8.346 8.446 8.546 8.646 8.746 8.846 8.946 9.046
do
cat > POSCAR < aaa
$i
0.0  0.5  0.5
0.5  0.0  0.5
0.5  0.5  0.0
2 4 8
Direct
0.0000000000000000   0.0000000000000000   0.0000000000000000
0.2500000000000000   0.2500000000000000   0.2500000000000000
0.6205000281333946   0.6205000281333943   0.6205000281333943
0.6205000281333944   0.6205000281333944  -1.8615000844001834
0.6205000281333947  -1.8615000844001834   0.6205000281333946
-1.8615000844001834   0.6205000281333947   0.6205000281333944
0.3849999904632571   0.3849999904632571   0.3849999904632571
0.8499000072479258   0.8499000072479258   0.8499000072479256
0.3849999904632571   0.3849999904632571  -1.1549999713897712
0.8499000072479258   0.8499000072479258  -2.5497000217437775
0.3849999904632572  -1.1549999713897714   0.3849999904632571
0.8499000072479259  -2.5497000217437775   0.8499000072479259
-1.1549999713897714   0.3849999904632572   0.3849999904632571
-2.5497000217437775   0.8499000072479260   0.8499000072479258
!
echo  '' a = $i angstrom ''; time ~/vasp
E='grep ''TOTEN'' OUTCAR | tail -1 | awk  '{printf  ''%12.6f \n'' , $5}' '
V='grep ''volume'' OUTCAR | tail -1 | awk  '{printf  ''%12.4f \n'' , %5}' '
echo $V  $E  >>EtVo.dat
done




结果输出文件EtVo.dat是空的,看了OUTCAR,最终结果只有最后一个晶格参数的计算。请问脚本那里出了问题?



还有如果不想得到体模量,只想优化,什么时候才有做状态方程拟合晶格参数必要,一般直接做全优化可以吗?还有做状态方程的时候,没有优化自由度,OUTCAR最后FORCE比较大,这个能量也不能说明问题吧
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

zhang668(金币+3): 2010-04-24 10:16
别人的脚本,不要拿过来就用,最好试一试。
你可以找一个算完的OUTCAR试一试,确定脚本没问题了,再进行计算。
EtVo.dat是空的,就说明是E和V的变量没有赋进去值。
我看你用的符号都是' ',应该是一个`,一个是'
         E='grep ''TOTEN'' OUTCAR | tail -1 | awk  '{printf  ''%12.6f \n'' , $5}' '
应该是E=`grep ''TOTEN'' OUTCAR | tail -1 | awk  '{printf  ''%12.6f \n'' , $5}' `
拟合物态方程绝对不是为了获得B0, 大部分的目的还是认为压力算的不准,不如拟合物态方程算出的压力准。至于拟合物态方程也紧紧限于立方结构,非立方结构由于加压之后,很可能晶格常数的比例变了,必须全优化后,才能拟合物态方程,也有不拟合的。
至于你说的FORCE很大, 那最大的原因就是你没有relax离子,否则不可能很大,或者你的收敛参数不够高。对应的就是isif=2, nsw=60
立方体系也可以全优化,但是那样比较浪费时间,没有这样的快!
真理是一点点接近的!
2楼2010-04-23 23:35:28
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wangzg9292

木虫 (正式写手)


zhang668(金币+1): 2010-04-24 11:04
gavinliu7390(金币+1):谢谢参与! 2010-04-24 11:23
脚本格式有的时候这样得不出结果的,你把后面的脚本的输出修改一下格式试一下
3楼2010-04-24 09:05:33
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zhang668

木虫 (正式写手)

多谢版主和楼上。确实是反引号的问题。
对于结构优化的问题,直接全优化精度可以吗?对于立方结构,文献中常见的优化是是先拟合物态方程得出晶格常数吧,对于非立方,如正交,直接用ISIF=3的多不?
4楼2010-04-24 11:08:41
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

对于非立方,必须用isif=3
真理是一点点接近的!
5楼2010-04-24 11:23:40
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经世济民

禁虫 (正式写手)

zhang668(金币+1): 2010-04-24 11:27
本帖内容被屏蔽

6楼2010-04-24 11:24:40
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zhang668

木虫 (正式写手)

我看教程上提供了一种同样利用拟合方程的方法。
就是先进行体积保持不变的离子驰豫计算,选择改变原胞的形状,再进行静态的计算。
然后改变体积,取到10个左右的点。对得到的能量体积拟合状态方程。
这个步骤确实复杂。

一般是直接ISIF=3吧。
7楼2010-04-24 11:27:42
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zhang668

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 经世济民 at 2010-04-24 11:24:40:

正交,直接用ISIF=3比较少

那对正交用拟合状态方程加不变体积的改变原胞形状的优化吗
8楼2010-04-24 11:29:34
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zhang668

木虫 (正式写手)

我用了40个节点并行来算,结果EtVo.dat文件里每个体积和能量输出了40遍,这个该怎么修改啊 。
9楼2010-04-24 11:45:33
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经世济民

禁虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
本帖内容被屏蔽

10楼2010-04-24 13:11:28
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