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tubaxu

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】为什么vasp运行时cpu使用率很不均衡? 已有4人参与

我自己编译通过了vasp,用单节点8个cpu实验时,发现第一个cpu使用率总是超过100%,甚至500%,或者800%,而第六、第七、第八个后面的cpu,利用率只有30%或50%,弄了好多次也不行。但是同样机子上别人装的vasp,却能保持8个cpu都是100%的运算。
   鄙人刚刚入门,水平很菜,请各位达人给予指点,不胜感谢。
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tubaxu

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by zengxiangm at 2010-04-24 20:11:23:
楼主,我编译数据库的时候有改一个关于线程的东西,好像是MAX_threads=1,不知你的是否也要修改

通过你的提示,我google一下,发现你说的这个东西,是数学库GotoBLAS2中的一个命令。于是,我把我安装的GotoBLAS2整个文件夹删除。然后重新解压得到GotoBLAS2。进入GotoBLAS2的目录内,vi Makefile.rule文件,把第41行的#NUM_THREADS=16前面的#去掉,改为NUM_THREADS=1。
    然后再运行./quickbuild.64bit 。成功得到一个叫libgoto2_*******.so的文件。把这个文件的目录输入到vasp.4.6的makefile内。再make以后。cpu就在100%正常工作了。

   多谢各位的帮忙,希望我的经历对大家有所帮助。
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10楼2010-04-26 01:09:36
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shrek826

金虫 (小有名气)

tubaxu(金币+3): 2010-04-22 19:17
你用的什么mpi编译?如果是mpich-1.2.7,有可能出现这种情况
2楼2010-04-21 23:20:14
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zzy870720z

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aylayl08(金币+1):谢谢解答 2010-04-22 10:07
tubaxu(金币+3): 2010-04-22 19:17
这个好像有时候会出这种问题,应该是并行的问题,听人说过单节点6核的效率不错,不知道是不是?
博学、审问、慎思、明辨、笃学
3楼2010-04-21 23:43:17
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tubaxu

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by shrek826 at 2010-04-21 23:20:14:
你用的什么mpi编译?如果是mpich-1.2.7,有可能出现这种情况

机子里面装的就mpich,没看那个版本(不会看),但不是mpich2。为什么别人编译的可以,我编译的就不行呢?
凡人作一事,便须全副精神注在此一事,首尾不懈。人而无恒,终生一无所成。
4楼2010-04-22 00:55:11
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