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tzkcarlos

银虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】SURFLEX以酶里面的金属离子作为活性位点对接

各位大虾。最近我在以酪氨酸酶为受体分子用SURFLEX进行分子对接。我看一篇文献说酶里面有两个铜离子,以此为活性位点。论文里面有一幅图

他是用AUTODOCK做的,那么我用SURFLEX的话也可以吧
但是我做出啦对接结果,只能看出氢键,但看不到铜离子,形成的口袋里铜离子也是在边缘。不知道拿SURFLEX应该怎样做呢?我到底有没有做对?

类似他这副图怎么用SYBYL得到?

我刚上手,见笑了,谢谢!
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