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【讨论】SURFLEX以酶里面的金属离子作为活性位点对接
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各位大虾。最近我在以酪氨酸酶为受体分子用SURFLEX进行分子对接。我看一篇文献说酶里面有两个铜离子，以此为活性位点。论文里面有一幅图 他是用AUTODOCK做的，那么我用SURFLEX的话也可以吧 但是我做出啦对接结果，只能看出氢键，但看不到铜离子，形成的口袋里铜离子也是在边缘。不知道拿SURFLEX应该怎样做呢？我到底有没有做对？ 类似他这副图怎么用SYBYL得到？ 我刚上手，见笑了,谢谢！ |
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