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【求助/交流】测序结果如何分析?
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xshving
新虫
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专业: 生物
[交流]
【求助/交流】测序结果如何分析?
已有4人参与
测序结果回来了,如何分析?
我是把序列和原序列比对了一下,然后看了峰图,没什么问题。
1.别的还需要做什么嘛?
2.如果发现了一个突变位点,怎么知道是对应的氨基酸发生了变化或者是简并密码子的变化?
谢谢指教。
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1楼
2010-04-20 21:23:06
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qiangxhou
木虫
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★
小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖交流
上NCBI上进行比对,如果同源性100%应该没问题。氨基酸比较时从起始密码子开始到终止密码子翻译成氨基酸进行比对就可以了。
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6楼
2010-04-21 06:22:53
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1110rainjob
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专业: 生物技术药物
氨基酸序列比对
★ ★
小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+1): 2010-04-20 22:10
你可以将原序列和测得的核苷酸序列从起始密码子开始进行翻译,然后进行比对。
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2楼
2010-04-20 21:27:07
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yujiaping1
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★
小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖交流
利用NCBI的ORF finder找到阅读框,看看突变位点编码氨基酸的三个碱基和原来三个碱基的差异,找到对应的氨基酸,看看有没有变化
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3楼
2010-04-20 21:28:51
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xshving
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性别: GG
专业: 生物
谢谢。。。
引用回帖:
Originally posted by
1110rainjob
at 2010-04-20 21:27:07:
你可以将原序列和测得的核苷酸序列从起始密码子开始进行翻译,然后进行比对。
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4楼
2010-04-20 23:42:50
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