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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】测序结果如何分析?
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xshving

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】测序结果如何分析? 已有4人参与

测序结果回来了，如何分析？

我是把序列和原序列比对了一下，然后看了峰图，没什么问题。

1.别的还需要做什么嘛？

2.如果发现了一个突变位点，怎么知道是对应的氨基酸发生了变化或者是简并密码子的变化？

谢谢指教。
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1楼 2010-04-20 21:23:06
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1110rainjob

铜虫 (小有名气)

氨基酸序列比对

★ ★
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lstt09nk(金币+1): 2010-04-20 22:10
你可以将原序列和测得的核苷酸序列从起始密码子开始进行翻译，然后进行比对。
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2楼2010-04-20 21:27:07
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yujiaping1

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
利用NCBI的ORF finder找到阅读框，看看突变位点编码氨基酸的三个碱基和原来三个碱基的差异，找到对应的氨基酸，看看有没有变化
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3楼2010-04-20 21:28:51
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xshving

新虫 (初入文坛)
谢谢。。。
引用回帖:
Originally posted by 1110rainjob at 2010-04-20 21:27:07:
你可以将原序列和测得的核苷酸序列从起始密码子开始进行翻译，然后进行比对。

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4楼2010-04-20 23:42:50
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xshving

新虫 (初入文坛)
谢谢。。。
引用回帖:
Originally posted by yujiaping1 at 2010-04-20 21:28:51:
利用NCBI的ORF finder找到阅读框，看看突变位点编码氨基酸的三个碱基和原来三个碱基的差异，找到对应的氨基酸，看看有没有变化

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5楼2010-04-20 23:43:06
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qiangxhou

木虫 (职业作家)
★
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上NCBI上进行比对，如果同源性100%应该没问题。氨基酸比较时从起始密码子开始到终止密码子翻译成氨基酸进行比对就可以了。
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6楼2010-04-21 06:22:53
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