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zouhui1115

铁虫 (初入文坛)

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[交流] 【求助】用ms计算两个分子的相互作用势已有9人参与

请问高手，ms能不能这样计算两个分子间的相互作用势呢？
譬如说想计算两个C60分子之间的相互作用势，
1建立两个C60分子组成的体系，然后用Dmol3计算体系的总能量E(total)；
2用Dmol3计算单个C60的总能量E(C60)
3用两个C60分子的体系的总能量减去两个单个分子的能量，
即E(total)-2*E(C60)
这样是否可以准确的得出两个C60分子之间的相互作用势呢？谢谢大家.
貌似这样计算有些问题，例如，我计算了氮分子和氧分子之间的相互作用势，
分子之间的角度如下图所示，得出相互作用势和分子中心距离的曲线
红圈部分很奇怪，一般的势能曲线应该是不会出现这种起伏的吧，
希望高手指教，非常感谢！

[ Last edited by zouhui1115 on 2010-4-21 at 12:54 ]

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1楼2010-04-20 17:05:17

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zouhui1115

铁虫 (初入文坛)

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谢谢楼上的耐心回答，我只扫描了N2和O2中心距离进行计算，没有做结构优化，看到一篇文献做这个的，算了两个分子之间多种构型的相互作用势，这是其中的一种，采用的是PBE函数。文章中采用的是CPMD代码计算的，但方法大概是这样，用总能量减去两个分子单独的能量，请问楼上，据你了解，是否采用CPMD代码得出的结果会令人信服一些呢？是否还有其他的软件会得出更加符合实际的结果呢？另外，C60的结果我也用Dmol算出来了，和文献的倒是比较符合。