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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 【求助】siesta3.0并行成功安装后不能并行的问题
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雁儿霏霏

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】siesta3.0并行成功安装后不能并行的问题 已有3人参与

感谢zhangguangping和诸位虫友的帮助，siesta并行版已经安装完毕，在双核工作站上安装，但在并行时却发生下列问题：

[shang@node2 ChemicalPotential]$ /home/shang/mpich-1.2.7p1/bin/mpirun -np 2 siesta h2o_4.out
connect to address 192.168.0.2: Connection refused
Trying krb4 rsh...
connect to address 192.168.0.2: Connection refused
trying normal rsh (/usr/bin/rsh)
node2: Connection refused
forrtl: error (69): process interrupted (SIGINT)


请问这一问题应该如何解决？siesta单核计算没问题
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我美丽我漂亮我是青岛嫚！
1楼 2010-04-20 10:00:17
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lvjian8596(金币+3):感谢交流！ 2010-07-20 21:11:07
引用回帖:
Originally posted by 雁儿霏霏 at 2010-07-20 10:55:09:


机房没有网线，不能远程，现在我执行
/home/bin/mpiexec -np 2 ./siesta h2o.defaultcell.out
No species found!!!
ERROR STOP from Node:    0
[0] MPI Abort by user Abor ...

No species found这说明你没有定义元素，或者相应元素的赝势文件你没有放在计算目录里面。
赞一下(2人) 回复此楼
弘德明志博学笃行
16楼2010-07-20 18:06:07
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hchfox

木虫 (正式写手)
★
雁儿霏霏(金币+2): 2010-04-20 15:32
zzy870720z(金币+1):谢谢提示 2010-07-14 08:21:05
"connect to address 192.168.0.2: Connection refused"....看看节点之间配置好了没。。。
引用回帖:
Originally posted by 雁儿霏霏 at 2010-04-20 10:00:17:
感谢zhangguangping和诸位虫友的帮助，siesta并行版已经安装完毕，在双核工作站上安装，但在并行时却发生下列问题：

[shang@node2 ChemicalPotential]$ /home/shang/mpich-1.2.7p1/bin/mpirun -np 2 siesta &l ...

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2楼2010-04-20 10:57:13
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
★
xiaohunhun(金币+1):xiexie 2010-04-20 11:55
雁儿霏霏(金币+4):感谢 2010-04-20 15:32
引用回帖:
Originally posted by 雁儿霏霏 at 2010-04-20 03:00:17:
感谢zhangguangping和诸位虫友的帮助，siesta并行版已经安装完毕，在双核工作站上安装，但在并行时却发生下列问题：

[shang@node2 ChemicalPotential]$ /home/shang/mpich-1.2.7p1/bin/mpirun -np 2 siesta &l ...

你生成了免SSH登录的密码了吗？
还有就是你的mpich去测试过了吗？去example下面的test， make一下，然后做一下测试看看mpich能不能正常并行（mpirun -np 2 cpi ）！
祝好运！
赞一下(1人) 回复此楼
弘德明志博学笃行
3楼2010-04-20 11:05:30
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
★
xiaohunhun(金币+1):xiexie 2010-04-20 11:56
引用回帖:
Originally posted by hchfox at 2010-04-20 03:57:13:
"connect to address 192.168.0.2: Connection refused"....看看节点之间配置好了没。。。


他现在看样子是在一个节点上算吧！这个节点总共就两个核！
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弘德明志博学笃行
4楼2010-04-20 11:07:40
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