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greatsaint

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】荧光定量pcr 已有5人参与

请问哪位能告知荧光定量PCR的时候做NTC的目的是什么?我的NTC怎么会总是污染呢?我的E=264%是怎么原因呢?怎么会这么大呢?谢谢!
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nmhsd

木虫 (正式写手)

由斜率计算的扩增效率高(一般软件的计算方法),常出现的可能是模板中存在抑制剂。模板在高浓度时,模板稀释倍数低,抑制剂浓度高,扩增效率低。稀释后,抑制剂浓度低,扩增效率高。但总体数据回归后由于高浓度的数据影响,导致斜率较小,最后E值计算偏大。
但是,不会偏离的太离谱,除非是用Trizol法提取RNA后,RNA用量又偏大时容易发生。
12楼2013-05-02 11:29:28
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yujiaping1

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
greatsaint(金币+1): 2010-04-19 21:14
greatsaint(金币+1):很好,谢谢 2010-04-19 21:15
amisking(金币+2): 2010-04-19 21:19
NTC和阴性对照不完全一样,拿病毒检测为例,阴性对照是指以非病毒感染样本为模板的PCR扩增,这个样本可以排除检测的不准确性,而NTC是指无模板对照,是防止操作、系统、药品等的污染,说明白这个道理,楼主应该知道做NTC的目的了吧。
我以前做病毒检测的定量PCR,发现NTC确实很容易污染,但现在做基因检测,基本不容易观测到污染现象了,这主要可能是由于质粒的气溶胶和水污染造成的,建议你PCR水常用常换,灭菌后分装,避免经常开瓶,而且要在超净台中制混合样,在超净台外加质粒、模板等
2楼2010-04-19 20:54:54
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greatsaint

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by yujiaping1 at 2010-04-19 20:54:54:
NTC和阴性对照不完全一样,拿病毒检测为例,阴性对照是指以非病毒感染样本为模板的PCR扩增,这个样本可以排除检测的不准确性,而NTC是指无模板对照,是防止操作、系统、药品等的污染,说明白这个道理,楼主应该知 ...

请问,我的扩增效率达到了264%是什么原因呢?怎么会这么大呢?谢谢
3楼2010-04-19 21:45:40
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石头8832

铜虫 (小有名气)


scelab(金币+1):欢迎多来交流!:tiger06: 2010-04-19 22:58
greatsaint(金币+1): 2010-04-20 08:58
你的目的基因可能是多拷贝的
4楼2010-04-19 22:02:26
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