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唐荣胜

铜虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】请问怎么将.pdb文件转换.dsv文件?望各位学长快点回复! 已有3人参与

DS软件里怎么将pdb文件转换为dsv文件?
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fmtzhangli

金虫 (小有名气)

没听说过dsv格式
2楼2010-04-19 11:03:00
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唐荣胜

铜虫 (初入文坛)

★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-04-19 15:43
从Files Explorer, 打开Samples | Tutorials | Protein Modeling | 2ptn.dsv
DS 将在一个新的3D 窗口中打开该蛋白
File | Insert From 中,找到2sta-I.dsv 文件,这是我的一个参考文献上的讲解!
3楼2010-04-19 11:10:15
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Tavel

铜虫 (小有名气)


ghcacj(金币+1):谢谢 2010-04-19 15:43
唐荣胜(金币+1): 2010-04-19 17:44
打开它再另存为即可。另存为的时候选对格式
4楼2010-04-19 15:31:20
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Tavel

铜虫 (小有名气)


ghcacj(金币+1):谢谢 2010-04-19 15:43
唐荣胜(金币+1): 2010-04-19 17:44
DSV是Discovery Studio Viewer的缩写
5楼2010-04-19 15:32:09
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唐荣胜

铜虫 (初入文坛)

谢谢!那这2种格式有什么区别啊?做ZDOCK时需要对蛋白进行什么处理吗?我是刚学这个,做毕业设计的,麻烦大侠帮我解答,万分感谢!
6楼2010-04-19 17:50:27
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Tavel

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-04-20 13:51
dsv是DS2.5的专用格式,跟DS2.1的msv一样。
要说DSV与PDB的区别,可能就在于DSV能包含更多的信息吧,具体我也没考察过,不好意思哦
7楼2010-04-20 12:50:38
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Tavel

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-04-21 10:10
引用回帖:
Originally posted by 唐荣胜 at 2010-04-19 17:50:27:
谢谢!那这2种格式有什么区别啊?做ZDOCK时需要对蛋白进行什么处理吗?我是刚学这个,做毕业设计的,麻烦大侠帮我解答,万分感谢!

需要,非结合部位的水要删掉,残基多余构象要删除。

一般二聚体要删掉其中的一半

....可能还有一引起其它要求吧,没有深入研究过
8楼2010-04-20 23:16:54
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