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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】请问怎么将.pdb文件转换.dsv文件？望各位学长快点回复！
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唐荣胜

铜虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】请问怎么将.pdb文件转换.dsv文件？望各位学长快点回复！ 已有3人参与

DS软件里怎么将pdb文件转换为dsv文件？
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1楼 2010-04-19 09:46:54
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fmtzhangli

金虫 (小有名气)
没听说过dsv格式
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2楼2010-04-19 11:03:00
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唐荣胜

铜虫 (初入文坛)
★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-04-19 15:43
从Files Explorer, 打开Samples | Tutorials | Protein Modeling | 2ptn.dsv
DS 将在一个新的3D 窗口中打开该蛋白
File | Insert From 中，找到2sta-I.dsv 文件，这是我的一个参考文献上的讲解！
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3楼2010-04-19 11:10:15
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Tavel

铜虫 (小有名气)
★
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-04-19 15:43
唐荣胜(金币+1): 2010-04-19 17:44
打开它再另存为即可。另存为的时候选对格式
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4楼2010-04-19 15:31:20
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Tavel

铜虫 (小有名气)
★
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-04-19 15:43
唐荣胜(金币+1): 2010-04-19 17:44
DSV是Discovery Studio Viewer的缩写
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5楼2010-04-19 15:32:09
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唐荣胜

铜虫 (初入文坛)
谢谢！那这2种格式有什么区别啊？做ZDOCK时需要对蛋白进行什么处理吗？我是刚学这个，做毕业设计的，麻烦大侠帮我解答，万分感谢！
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6楼2010-04-19 17:50:27
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Tavel

铜虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-04-20 13:51
dsv是DS2.5的专用格式，跟DS2.1的msv一样。
要说DSV与PDB的区别，可能就在于DSV能包含更多的信息吧，具体我也没考察过，不好意思哦
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7楼2010-04-20 12:50:38
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Tavel

铜虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-04-21 10:10
引用回帖:
Originally posted by 唐荣胜 at 2010-04-19 17:50:27:
谢谢！那这2种格式有什么区别啊？做ZDOCK时需要对蛋白进行什么处理吗？我是刚学这个，做毕业设计的，麻烦大侠帮我解答，万分感谢！

需要，非结合部位的水要删掉，残基多余构象要删除。

一般二聚体要删掉其中的一半

....可能还有一引起其它要求吧，没有深入研究过
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8楼2010-04-20 23:16:54
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