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574384607

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】MS discover 能加水溶液吗,已有7人参与

MS discover 能加水溶液盒子( ⊙ o ⊙ )啊!,怎么加啊,什么时候加啊
文献中加的是spc水溶液,和自己建的有什么不同?

[ Last edited by 574384607 on 2010-5-16 at 09:27 ]
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574384607

银虫 (小有名气)

没人做过吗
2楼2010-04-19 20:37:43
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574384607

银虫 (小有名气)

dengdainidedaolaia
3楼2010-04-27 08:02:46
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574384607

银虫 (小有名气)

5楼2010-04-28 16:23:03
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574384607

银虫 (小有名气)

6楼2010-04-29 21:33:45
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574384607

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by qasd at 2010-04-30 16:54:35:
minimize 5000 steps then ...

谢谢
你说是再优化,我用的是已经优化后收敛的啦啊,是不是体系大了容易这样啊,还是跟摆放位置由有关啊?
8楼2010-05-01 08:24:21
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574384607

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by qasd at 2010-05-01 10:13:05:
用的什么系综?

NVT,温度控制v s,力场cvff
10楼2010-05-01 14:43:16
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574384607

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by qasd at 2010-05-01 19:13:40:
改NPT,可能初态不太合理

好的,谢谢。我试试看看
13楼2010-05-02 08:58:04
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574384607

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by Tower.Tsu at 2010-05-02 01:58:53:
我也经常遇到这个问题,原子数目比较多时,或者NVT温度设置过高时都出现这个问题。想知道造成这个的原因。是因为数值计算过程中误差累积导致病态?

原子数目确实比较多,我也在这问了老多天啦,没什么进展
14楼2010-05-02 09:00:14
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574384607

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by huangnana at 2010-05-04 16:42:50:
我想问一下你的结构已优化收敛了,这个错误的结果是从何而来
顺便说一下,我也出现过这个错误,是在Discover-Dynamic后出现的,
解决办法:先用minmize优化,使能量降低,然后再用Dynamic就好了
原因:结构不太 ...

当然也是在Discover-Dynamic后出现的,用minmize优化,我的是在优化收敛了之后也可能出现啊,我怀疑可能是跟摆放位置也有关
16楼2010-05-05 09:42:45
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