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enola

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[交流] 【求助】ms模型原子坐标的导出 已有6人参与

在ms里键了硅的惯用晶胞(conventional cell),我数了下有18个可见的硅原子,可是我按照网上的方法,运算下ms,再导出坐标,剩下8个坐标,我想知道这之间的对应关系是什么啊?他的晶体结构类型是什么呢?scc,fcc。记得有个大侠跟我说过,我不是很懂
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timeflies..
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shoutingabc

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by enola at 2010-10-01 16:27:47
哈哈。。多多交流...

您好!我想请问一下,在MS中建立晶胞以后,不可以直接输出.cif或者.car文件直接提取坐标文件吗?
还有一个问题就是,输出的坐标数据只会包含属于这个晶胞的原子的坐标吗?就比如您说的,晶胞在MS中显示有18个原子,但是输出的原子坐标只有8个!
11楼2018-01-22 20:41:06
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lono75

铁杆木虫 (著名写手)


zxzj05(金币+1):3Q 2010-04-11 21:05
角上是1/8
面上是1/2
由天命,成人事!
2楼2010-04-11 13:05:31
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dingfengbo

新虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by enola at 2010-04-11 11:06:46:
在ms里键了硅的惯用晶胞(conventional cell),我数了下有18个可见的硅原子,可是我按照网上的方法,运算下ms,再导出坐标,剩下8个坐标,我想知道这之间的对应关系是什么啊?他的晶体结构类型是什么呢?scc,fcc ...

我想问一下用ms建了硅的惯用晶胞后,怎样导出坐标呢?我按网上说的先导出成.car文件,再用写字板打开,发现那里面的内容不是fractional 坐标!
3楼2010-09-29 09:33:55
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enola

捐助贵宾 (正式写手)


zxzj05(金币+1):参与奖励! 2010-10-01 20:28:42
引用回帖:
Originally posted by dingfengbo at 2010-09-29 09:33:55:

我想问一下用ms建了硅的惯用晶胞后,怎样导出坐标呢?我按网上说的先导出成.car文件,再用写字板打开,发现那里面的内容不是fractional 坐标!

ms里建好结构后,运行下castep,任务随便选,点stop,然后看输出文件里的.castep文件,你面有pwscf所要的详细信息:
*******************************************************************************
  

                           -------------------------------
                                      Unit Cell
                           -------------------------------
        Real Lattice(A)                      Reciprocal Lattice(1/A)
   9.9560000   0.0000000   0.0000000        0.6310954   0.0000000   0.0000000
   0.0000000   9.9560000   0.0000000        0.0000000   0.6310954   0.0000000
   0.0000000   0.0000000  13.8960000        0.0000000   0.0000000   0.4521578

                       Lattice parameters(A)       Cell Angles
                    a =    9.956000          alpha =   90.000000
                    b =    9.956000          beta  =   90.000000
                    c =   13.896000          gamma =   90.000000
timeflies..
4楼2010-09-29 21:09:43
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