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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 其他 » 【其他】第一性计算数据处理经验有奖征集
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qli0218

木虫 (小有名气)

[交流] 【其他】第一性计算数据处理经验有奖征集 已有20人参与

现在做第一性原理计算越来越多，但是如何发表高层次的文章却与处理、挖掘所得数据的深度有着密切的联系。所以希望大家互帮互助，分享处理数据的经验。

大家所用软件都不一样，所以得到的数据文件也有不同，所以请大家按照以下格式回帖，写下自己处理数据的例子。

例子：
CODE:
计算软件：DMOL
处理的文件：.grd
应用软件：MATLAB
作用：按照自己的需求画二维电荷密度图
方法：读出.grd中的数据，按照自己的要求重新切面，得到切面上各个坐标的电荷密度，然后画出二维电荷密度图。也可得到电荷密度矩阵倒入origin中绘图。
程序（可选）：如果有自己用得好的程序，也可以共享。


参与回帖者每人奖励5个金币，对于提供程序的回帖者奖励10个金币。

PS:感谢aylayl08版主的帮助

[ Last edited by aylayl08 on 2010-4-6 at 14:22 ]
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1楼 2010-04-06 14:11:26
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞
支持一下！
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真理是一点点接近的！
2楼2010-04-06 14:31:47
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hometownlove

金虫 (小有名气)
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努力科研，不断学习！
3楼2010-04-06 14:57:52
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有目标有希望

木虫 (著名写手)
这个有点难
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4楼2010-04-06 16:56:02
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christian

木虫 (正式写手)
支持一下哈！！！那样估计有点难！呵呵！
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你出生的时候，你哭着，周围的人笑着；你逝去的时候，你笑着，而周围的人在哭
5楼2010-04-06 17:01:55
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goldenfisher

金虫 (著名写手)
qli0218(金币+5):谢谢参与！非常好！ 2010-04-06 18:23
我来说一个，紧跟版主脚步：

计算软件：pwscf
处理的文件：.xsf
应用软件：xcrysden
作用：原子构型图、电荷密度、自旋密度的三维图等
方法：原子构型可以直接在xscrysden中画出。对其它参数，首先利用pwscf计算scf得到体系电荷分布，再经过自带的处理程序得到xsf格式的文件，然后导入xcrysden，选择合适的参数，画出电荷密度的三维分布。现在来说，三维分布更直观，更有意义。
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6楼2010-04-06 17:36:53
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aylayl08

荣誉版主 (文坛精英)

至尊天蝎

优秀版主
qli0218(金币+5):谢谢大蝎捧场！！呵呵！ 2010-04-06 19:00
来个最简单的，呵呵：
计算软件：CASTEP
处理的文件：.charg_frm
应用软件：Origin
作用：画二维电荷密度图
方法：选取出所要分析的某个晶面的.charg_frm中的数据，得到切面上各个坐标的电荷密度，之后转换成矩阵（详细见电荷密度图画法教程）绘图。具体做法见：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1627651
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珍惜拥有，快乐人生!欢迎光临计算模拟区(*^__^*)。。。。。。。。。。。。。。
7楼2010-04-06 18:57:00
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锐利的碎片

木虫 (正式写手)

star watcher
最简单的，elk。不用处理，因为都弄好了，直接画就好了。
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8楼2010-04-06 19:28:28
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锐利的碎片

木虫 (正式写手)

star watcher
qli0218(金币+1):具体如何操作能否详细一点，参加活动请按格式写，我好给你金币阿 2010-04-06 19:57
vasp光学计算后可以在outcar里找到介电函数的实部和虚部。然后可以计算光电导率，吸收系数。
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9楼2010-04-06 19:35:27
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longerwell

木虫 (正式写手)
Matlab软件功能比较强的，我在学习中
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向大家学习
10楼2010-04-06 22:25:35
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