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qli0218

木虫 (小有名气)

[交流] 【其他】第一性计算数据处理经验有奖征集 已有20人参与

现在做第一性原理计算越来越多,但是如何发表高层次的文章却与处理、挖掘所得数据的深度有着密切的联系。所以希望大家互帮互助,分享处理数据的经验。

大家所用软件都不一样,所以得到的数据文件也有不同,所以请大家按照以下格式回帖,写下自己处理数据的例子。

例子:
CODE:
计算软件:DMOL
处理的文件:.grd
应用软件:MATLAB
作用:按照自己的需求画二维电荷密度图
方法:读出.grd中的数据,按照自己的要求重新切面,得到切面上各个坐标的电荷密度,然后画出二维电荷密度图。也可得到电荷密度矩阵倒入origin中绘图。
程序(可选):如果有自己用得好的程序,也可以共享。


参与回帖者每人奖励5个金币,对于提供程序的回帖者奖励10个金币。

PS:感谢aylayl08版主的帮助

[ Last edited by aylayl08 on 2010-4-6 at 14:22 ]
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goldenfisher

金虫 (著名写手)

qli0218(金币+5):谢谢参与!非常好! 2010-04-06 18:23
我来说一个,紧跟版主脚步:

计算软件:pwscf
处理的文件:.xsf
应用软件:xcrysden
作用:原子构型图、电荷密度、自旋密度的三维图等
方法:原子构型可以直接在xscrysden中画出。对其它参数,首先利用pwscf计算scf得到体系电荷分布,再经过自带的处理程序得到xsf格式的文件,然后导入xcrysden,选择合适的参数,画出电荷密度的三维分布。现在来说,三维分布更直观,更有意义。
6楼2010-04-06 17:36:53
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

支持一下!
真理是一点点接近的!
2楼2010-04-06 14:31:47
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christian

木虫 (正式写手)

支持一下哈!!!那样估计有点难!呵呵!
你出生的时候,你哭着,周围的人笑着;你逝去的时候,你笑着,而周围的人在哭
5楼2010-04-06 17:01:55
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aylayl08

荣誉版主 (文坛精英)

至尊天蝎

优秀版主

qli0218(金币+5):谢谢大蝎捧场!!呵呵! 2010-04-06 19:00
来个最简单的,呵呵:
计算软件:CASTEP
处理的文件:.charg_frm
应用软件:Origin
作用:画二维电荷密度图
方法:选取出所要分析的某个晶面的.charg_frm中的数据,得到切面上各个坐标的电荷密度,之后转换成矩阵(详细见电荷密度图画法教程)绘图。具体做法见:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1627651
珍惜拥有,快乐人生!欢迎光临计算模拟区(*^__^*)。。。。。。。。。。。。。。
7楼2010-04-06 18:57:00
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