24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 294  |  回复: 1
当前主题已经存档。

ansrang

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】ubuntu9.1下安装gromacs的问题

我按照官网上的命令解压后安装的,如下:

export SOFT=$HOME/software
export CPPFLAGS="-I$SOFT/include"
export LDFLAGS="-L$SOFT/lib"
export NCPU=2
export PATH="$PATH":$SOFT/bin
cd openmpi-1.2.8
./configure --prefix=$SOFT && make -j $NCPU && make install
cd ../fftw-3.1.3
./configure --prefix=$SOFT --enable-float && make -j $NCPU && make install
cd ../gsl-1.11
./configure --prefix=$SOFT && make -j $NCPU && make install
cd ../gromacs-4.0.5
./configure --prefix=$SOFT --with-gsl && make -j $NCPU && make install
make distclean
./configure --prefix=$SOFT --program-suffix=_mpi --enable-mpi --with-gsl && make mdrun -j $NCPU && make install-mdrun
cd ../openmotif-2.3.1
./configure --prefix=$SOFT && make -j $NCPU && make install
cd ../grace-5.1.22
./configure --prefix=$SOFT && make -j $NCPU && make install && ln -s $SOFT/grace/bin/xmgrace $SOFT/bin/xmgrace
. $SOFT/bin/GMXRC

我有如下问题:
1 开始输入第一行命令的时候是在什么目录下操作?(主目录?还是某个解压后的文件目录?)
2 我在主目录下输入前几个export后没什么反应,也没发现相应目录下产生新的文件夹,请问这个是正常的吗,还是说所有安装命令完成后才后有新的文件夹生成?
3 安装完怎么运行gromacs呢?
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qasd

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+2):谢谢 2010-04-03 09:34
上边那些可以不做,最后手动改.bashrc
luck一下
2楼2010-04-02 20:01:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ansrang 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 软件工程求调剂22软工296分求调剂,接受跨调 +4 yangchen2017 2026-04-08 5/250 2026-04-08 21:56 by 土木硕士招生
[考研] 325分化学调剂 +9 15771691647 2026-04-02 9/450 2026-04-08 19:21 by ruoyu867
[考研] 材料专硕(0856) 339分求调剂 +16 哈哈哈鹅哈哈哈 2026-04-05 16/800 2026-04-08 16:02 by luoyongfeng
[硕博家园] 有没有学校材料专业收跨调(一志愿085410) +3 momo(上岸版) 2026-04-06 6/300 2026-04-08 14:53 by 化学521
[考研] 285求调剂 +18 AZMK 2026-04-02 19/950 2026-04-08 10:33 by xingguangj
[考研] 求调剂 +28 111623 2026-04-04 33/1650 2026-04-08 09:24 by 泽润东方
[考研] 材料调剂 +13 汉123456 2026-04-07 14/700 2026-04-07 22:53 by 来看流星雨10
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +6 崔wj 2026-04-02 6/300 2026-04-07 18:45 by 求调剂zz
[考研] 一志愿北京2,材料与化工308求调剂 +16 熊二想上岸 2026-04-04 17/850 2026-04-07 14:58 by BruceLiu320
[考研] 319求调剂 +3 handrui 2026-04-05 3/150 2026-04-06 09:33 by jp9609
[考研] 301求调剂 +6 细胞相关蛋白 2026-04-02 10/500 2026-04-06 08:34 by jp9609
[考研] 生物与医药086000调剂一志愿西北农林320分 +3 美美女士 2026-04-03 3/150 2026-04-05 21:55 by 学员8dgXkO
[考研] 308求调剂 +4 maverick^_^ 2026-04-03 4/200 2026-04-05 19:08 by 蓝云思雨
[考研] 295求调剂 +8 FZAC123 2026-04-03 8/400 2026-04-05 17:46 by 蓝云思雨
[考研] 358求调剂 +7 秋gk 2026-04-04 7/350 2026-04-05 13:29 by huangmoli
[考研] 考研调剂 +5 四川王涛 2026-04-04 5/250 2026-04-04 22:18 by 啵啵啵0119
[考研] 材料与化工306分找调剂 +23 沧海轻舟e 2026-04-02 27/1350 2026-04-04 21:52 by laoshidan
[考研] 324求调剂 +14 想上学求调 2026-04-02 15/750 2026-04-04 20:31 by 无际的草原
[考研] 274求调剂 +9 顺理成张 2026-04-03 10/500 2026-04-03 15:10 by 啊俊!
[考研] 求调剂 +3 心想事成可 2026-04-03 3/150 2026-04-03 11:22 by wangjy2002
信息提示
请填处理意见