24小时热门版块排行榜    

查看: 289  |  回复: 1
当前主题已经存档。

ansrang

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】ubuntu9.1下安装gromacs的问题

我按照官网上的命令解压后安装的,如下:

export SOFT=$HOME/software
export CPPFLAGS="-I$SOFT/include"
export LDFLAGS="-L$SOFT/lib"
export NCPU=2
export PATH="$PATH":$SOFT/bin
cd openmpi-1.2.8
./configure --prefix=$SOFT && make -j $NCPU && make install
cd ../fftw-3.1.3
./configure --prefix=$SOFT --enable-float && make -j $NCPU && make install
cd ../gsl-1.11
./configure --prefix=$SOFT && make -j $NCPU && make install
cd ../gromacs-4.0.5
./configure --prefix=$SOFT --with-gsl && make -j $NCPU && make install
make distclean
./configure --prefix=$SOFT --program-suffix=_mpi --enable-mpi --with-gsl && make mdrun -j $NCPU && make install-mdrun
cd ../openmotif-2.3.1
./configure --prefix=$SOFT && make -j $NCPU && make install
cd ../grace-5.1.22
./configure --prefix=$SOFT && make -j $NCPU && make install && ln -s $SOFT/grace/bin/xmgrace $SOFT/bin/xmgrace
. $SOFT/bin/GMXRC

我有如下问题:
1 开始输入第一行命令的时候是在什么目录下操作?(主目录?还是某个解压后的文件目录?)
2 我在主目录下输入前几个export后没什么反应,也没发现相应目录下产生新的文件夹,请问这个是正常的吗,还是说所有安装命令完成后才后有新的文件夹生成?
3 安装完怎么运行gromacs呢?
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qasd

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+2):谢谢 2010-04-03 09:34
上边那些可以不做,最后手动改.bashrc
luck一下
2楼2010-04-02 20:01:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ansrang 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] [复试调剂]西南科技大学国防/材料导师推荐 +3 尖角小荷 2026-03-16 6/300 2026-03-16 23:21 by 尖角小荷
[考研] 0703化学调剂 ,六级已过,有科研经历 +7 曦熙兮 2026-03-15 7/350 2026-03-16 16:34 by houyaoxu
[考研] 311求调剂 +5 26研0 2026-03-15 5/250 2026-03-16 16:21 by a不易
[考研] 材料与化工求调剂 +3 为学666 2026-03-16 3/150 2026-03-16 15:09 by 加号+
[考研] 求老师收留调剂 +4 jiang姜66 2026-03-14 5/250 2026-03-15 20:11 by Winj1e
[考研] 机械专硕调剂 +3 笨笨兔子 2026-03-12 3/150 2026-03-15 20:02 by 栗子粥?
[考研] 267一志愿南京工业大学0817化工求调剂 +5 SUICHILD 2026-03-12 5/250 2026-03-14 14:53 by jean5056
[考研] 290求调剂 +4 @将就将就看 2026-03-10 8/400 2026-03-14 14:23 by 千千运气
[考研] 331求调剂(0703有机化学 +5 ZY-05 2026-03-13 6/300 2026-03-14 10:51 by Jy?
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-03-13 4/200 2026-03-14 08:37 by zhukairuo
[基金申请] 有必要更换申报口吗 20+3 fannyamoy 2026-03-11 3/150 2026-03-14 00:52 by zhanghaozhu
[考研] 307求调剂 +7 超级伊昂大王 2026-03-10 7/350 2026-03-14 00:49 by JourneyLucky
[考研] [0860]321分求调剂,ab区皆可 +4 宝贵热 2026-03-13 4/200 2026-03-13 22:01 by 星空星月
[考研] 333求调剂 +3 球球古力 2026-03-11 3/150 2026-03-13 21:27 by JourneyLucky
[考研] (081700)化学工程与技术-298分求调剂 +12 11啦啦啦 2026-03-11 35/1750 2026-03-13 21:25 by JourneyLucky
[考研] 332求调剂 +3 Zz版 2026-03-13 3/150 2026-03-13 20:36 by 18595523086
[考研] 求b区学校调剂 +3 周56 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:20 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +3 程雨杭 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:06 by JourneyLucky
[考博] 读博申请 +5 感dd 2026-03-10 7/350 2026-03-11 17:02 by QGZDSYS
[考研] 化工0817调剂 +8 灿若星晨 2026-03-10 8/400 2026-03-10 22:44 by 星空星月
信息提示
请填处理意见