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ansrang

木虫 (小有名气)

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[交流] 【求助】ubuntu9.1下安装gromacs的问题

我按照官网上的命令解压后安装的，如下：

export SOFT=$HOME/software
export CPPFLAGS="-I$SOFT/include"
export LDFLAGS="-L$SOFT/lib"
export NCPU=2
export PATH="$PATH":$SOFT/bin
cd openmpi-1.2.8
./configure --prefix=$SOFT && make -j $NCPU && make install
cd ../fftw-3.1.3
./configure --prefix=$SOFT --enable-float && make -j $NCPU && make install
cd ../gsl-1.11
./configure --prefix=$SOFT && make -j $NCPU && make install
cd ../gromacs-4.0.5
./configure --prefix=$SOFT --with-gsl && make -j $NCPU && make install
make distclean
./configure --prefix=$SOFT --program-suffix=_mpi --enable-mpi --with-gsl && make mdrun -j $NCPU && make install-mdrun
cd ../openmotif-2.3.1
./configure --prefix=$SOFT && make -j $NCPU && make install
cd ../grace-5.1.22
./configure --prefix=$SOFT && make -j $NCPU && make install && ln -s $SOFT/grace/bin/xmgrace $SOFT/bin/xmgrace
. $SOFT/bin/GMXRC

我有如下问题：
1 开始输入第一行命令的时候是在什么目录下操作？（主目录？还是某个解压后的文件目录？）
2 我在主目录下输入前几个export后没什么反应，也没发现相应目录下产生新的文件夹，请问这个是正常的吗，还是说所有安装命令完成后才后有新的文件夹生成？
3 安装完怎么运行gromacs呢？

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