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ansrang

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】ubuntu9.1下安装gromacs的问题

我按照官网上的命令解压后安装的,如下:

export SOFT=$HOME/software
export CPPFLAGS="-I$SOFT/include"
export LDFLAGS="-L$SOFT/lib"
export NCPU=2
export PATH="$PATH":$SOFT/bin
cd openmpi-1.2.8
./configure --prefix=$SOFT && make -j $NCPU && make install
cd ../fftw-3.1.3
./configure --prefix=$SOFT --enable-float && make -j $NCPU && make install
cd ../gsl-1.11
./configure --prefix=$SOFT && make -j $NCPU && make install
cd ../gromacs-4.0.5
./configure --prefix=$SOFT --with-gsl && make -j $NCPU && make install
make distclean
./configure --prefix=$SOFT --program-suffix=_mpi --enable-mpi --with-gsl && make mdrun -j $NCPU && make install-mdrun
cd ../openmotif-2.3.1
./configure --prefix=$SOFT && make -j $NCPU && make install
cd ../grace-5.1.22
./configure --prefix=$SOFT && make -j $NCPU && make install && ln -s $SOFT/grace/bin/xmgrace $SOFT/bin/xmgrace
. $SOFT/bin/GMXRC

我有如下问题:
1 开始输入第一行命令的时候是在什么目录下操作?(主目录?还是某个解压后的文件目录?)
2 我在主目录下输入前几个export后没什么反应,也没发现相应目录下产生新的文件夹,请问这个是正常的吗,还是说所有安装命令完成后才后有新的文件夹生成?
3 安装完怎么运行gromacs呢?
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qasd

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+2):谢谢 2010-04-03 09:34
上边那些可以不做,最后手动改.bashrc
luck一下
2楼2010-04-02 20:01:33
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