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【求助】关于加氢的问题已有5人参与
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| 最近解出个结构, 理论加上氢后,感觉挺合理的,就是保存了 后 ,再 XL 一下,提示 某个氢和某个碳原子相连 ,xl 运行不了 ,不知道怎么办?再有就是配位的水分子的氧原子只能理论加一个氢,不知道另一个氢怎么加 ?好像是有一个固定加氢的命令 hfix 3 -1.2 不知道这个命令,具体加载ins文件中的什么位置?请高人指点,不胜感激 |
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4楼2010-04-01 09:59:55
2楼2010-04-01 08:49:15
3楼2010-04-01 09:57:13
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zhangxin11(金币+5): 2010-04-01 12:02
wsht212(金币+1):谢谢交流,专业! 2010-04-13 22:33
帝夫(金币+4):感谢耐心细致的解答· 2010-04-20 18:10
zhangxin11(金币+5): 2010-04-01 12:02
wsht212(金币+1):谢谢交流,专业! 2010-04-13 22:33
帝夫(金币+4):感谢耐心细致的解答· 2010-04-20 18:10
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这个命令只要在PLAN和WGHT之间就行。 hadd自动按照C,N,O周围的成键类型及键角进行理论加氢,但这时要注意某些原子周围的氢可 能加错,特别是对构型为 X-C-Y 的碳原子X-C-Y键角更靠近109°,将按仲碳加两个氢,而若更靠近120°,则按芳香烃类型加一个氢。对于这些原子,若加氢类型不符合,可以用kill命令首先删除这些原子上加入的H原子,再通过指定加氢类型来加氢。 给我个邮箱,我给你发个ppt上面说的很清楚 |

5楼2010-04-01 10:44:12













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