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zhangxin11

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于加氢的问题已有5人参与

最近解出个结构,  理论加上氢后,感觉挺合理的,就是保存了 后 ,再 XL 一下,提示  某个氢和某个碳原子相连 ,xl 运行不了 ,不知道怎么办?再有就是配位的水分子的氧原子只能理论加一个氢,不知道另一个氢怎么加 ?好像是有一个固定加氢的命令  hfix 3 -1.2 不知道这个命令,具体加载ins文件中的什么位置?请高人指点,不胜感激
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冷月8008

银虫 (小有名气)

★ ★
wsht212(金币+1):谢谢交流 2010-04-13 22:32
帝夫(金币+1):感谢回帖应助 2010-04-20 18:09
XL运行不了就把上步的操作在ins文件中删除,若是只进行了加氢操作,说明还是有问题
3楼2010-04-01 09:57:13
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ruenning

金虫 (正式写手)

路过,看看!!
2楼2010-04-01 08:49:15
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冷月8008

银虫 (小有名气)

★ ★
wsht212(金币+1):谢谢交流 2010-04-13 22:32
帝夫(金币+1):谢谢应答! 2010-04-20 18:10
理论加氢上不去的就傅立叶加氢,就是把那些看起来像氢的Q峰强制指认为H就行了
4楼2010-04-01 09:59:55
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★
zhangxin11(金币+5): 2010-04-01 12:02
wsht212(金币+1):谢谢交流,专业! 2010-04-13 22:33
帝夫(金币+4):感谢耐心细致的解答· 2010-04-20 18:10
这个命令只要在PLAN和WGHT之间就行。
hadd自动按照C,N,O周围的成键类型及键角进行理论加氢,但这时要注意某些原子周围的氢可
能加错,特别是对构型为 X-C-Y 的碳原子X-C-Y键角更靠近109°,将按仲碳加两个氢,而若更靠近120°,则按芳香烃类型加一个氢。对于这些原子,若加氢类型不符合,可以用kill命令首先删除这些原子上加入的H原子,再通过指定加氢类型来加氢。
给我个邮箱,我给你发个ppt上面说的很清楚
学无止境
5楼2010-04-01 10:44:12
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