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[交流]
【求助/交流】请教一个关于haploview的问题,涉及x染色体的
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各位站友: 我最近在做连锁不平衡分析,测定的SNP是x染色体上的,也就是说男性只有一个等位基因。按照haploview要求的格式(把两个等位基因分开输入),就会产生一些空项,我试了一下这样haploview会报错,说ped文件的“column mismatch”(也不完全确定是有空项的原因)。 我试了两种解决方法。1,把男性都按照纯合子补充数据。2,只分析女性中的LD。两种方法结果虽然比较近似,我还是想请教一下,到底哪种是正确的?我在haploview的说明书里没找到依据。向各位大牛请教了!谢谢! |
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