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[交流]
【求助/交流】请教一个关于haploview的问题，涉及x染色体的
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各位站友： 我最近在做连锁不平衡分析，测定的SNP是x染色体上的，也就是说男性只有一个等位基因。按照haploview要求的格式（把两个等位基因分开输入），就会产生一些空项，我试了一下这样haploview会报错，说ped文件的“column mismatch”（也不完全确定是有空项的原因）。 我试了两种解决方法。1，把男性都按照纯合子补充数据。2，只分析女性中的LD。两种方法结果虽然比较近似，我还是想请教一下，到底哪种是正确的？我在haploview的说明书里没找到依据。向各位大牛请教了！谢谢！ |
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 有助于于我的SNP |
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