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xiaoqian830606

金虫 (小有名气)

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[交流] 【求助】请教一下关于：比较分子模拟软件已有2人参与

比较分子模拟软件中Solids-Docking模块和Soption模块在处理小分子吸附计算方面的异同。老师要求大约2000至3000字的，不知道如何下手？各位虫友帮一下忙吧！！感谢

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1楼 2010-03-29 10:11:10

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ghcacj

荣誉版主 (著名写手)

阿超

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管辖: 分子模拟

★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+4):谢谢 2010-03-30 08:54

其实个人建议如果你想对A和B软件（程序）进行比对的话，就在文献中找到一个难度相对适中的例子，用两个软件来重复看看（太简单比不出软件的缺点，太难了估计自己一时难于搞定，费时间），这样就可以通过实例发现，每个软件的长处在什么地方（计算时间是否cheap，提供的方法选择余地，建模是否方便……），与每个软件的短处（是否能达到主流水平的设置）
就吸附来说，主要看，力场多不多，力场参数是否能按照自己的意愿修改（添加删除等等），小分子模型建立方便否（比如氮气分子和一氧化碳分子中很多文献采用有虚原子的模拟），是否可以优化计算时间（程序中一般都有Map之类文件加速运算，貌似软件都必须on the fly），断电后是否可以接着算…………