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碧落红妆

[交流] 【讨论】CoMFA叠合问题已有2人参与

在做CoMFA之前需要叠合分子,是否分子都需要加氢加电再来叠合呢?
另外,分子加电应该在哪一步做比较好?谢谢大家
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bonnyzj

木虫 (小有名气)

★ ★
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ghcacj(金币+1):谢谢 2010-03-24 10:06
不加氢加电怎么优化分子呢?
2楼2010-03-24 08:27:51
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绿茶QJM

银虫 (小有名气)

★ ★ ★
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ghcacj(金币+2):谢谢 2010-04-09 10:14
在第一步,局部优化时候就要加电荷,MINIMIZE里有电荷。也就意味着,叠合前就要加电荷
3楼2010-03-25 08:59:59
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碧落红妆

谢谢各位,顺便再问下,那个region的设置有些什么技巧呢
4楼2010-04-07 17:00:06
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tingjun

木虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-04-09 10:14
先优化好分子,在优化分子时要加上电荷,region的设置要看结构的相似以及骨架的公共程度
5楼2010-04-09 10:00:46
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