24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 1243  |  回复: 15
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zxwasd

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】构型优化计算

大家好,我最近在做一个氨基酸分子的优化,分子是用gaussview中氨基酸库画出来的,优化的命令为:# opt freq rb3lyp/6-311++g(d,p) geom=connectivity,优化的基组与文献相同,但结果与文献的差别很大,看优化构型,与文献的也明显不同。问了一下,说初始结构与人家的不同,我怎么能确保我输入的初始结构是合理的或正确的?是否要找到最优构象,如果是该如何做?
另,我的能量似乎也有波动,请大家指点,谢谢!

        SCF Done:  E(RB+HF-LYP)
1        -800.691659498000
2        -800.697552148000
3        -800.698367068000
4        -800.698539566000
5        -800.698614460000
6        -800.698661897000
7        -800.698660705000
8        -800.698690923000
9        -800.698710726000
10        -800.698723086000
11        -800.698728686000
12        -800.698731498000
13        -800.698733063000
14        -800.698731623000
15        -800.698733576000
16        -800.698733685000
17        -800.698734365000
18        -800.698734389000
19        -800.698734386000
20        -800.698734398000
21        -800.698734391000
22        -800.698734401000
23        -800.698734395000
24        -800.698734395000
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zxwasd

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 王中学 at 2010-03-25 11:34:38:
如果可以的情况下,你可以发信能否要到文献分子的坐标,否则要找到和文献一样的构型,不太容易。

谢谢你的回复!“要找到和文献一样的构型,不太容易”,那么我如何判断自己的计算结果是正确的或是合理的?
12楼2010-03-25 21:19:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 16 个回答

qzhaosdu

金虫 (著名写手)

你只是说优化的基组和文献相同,那方法呢?文献里也是用B3LYP吗?
Anewday,anewhour,anewminute,anewpeople.
2楼2010-03-20 16:29:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zxwasd

金虫 (小有名气)

方法和基组都一样!
3楼2010-03-20 22:20:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zxwasd

金虫 (小有名气)

希望高手指点,谢谢!
4楼2010-03-21 09:43:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见