24小时热门版块排行榜    

查看: 3361  |  回复: 19
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zhaoxia2501

金虫 (小有名气)


[资源] 【分享】单点能

这几天写文章遇到一个单点能问题,向同学请教了才搞清楚,很多人都讲在输出文件中E(RHF)代表单点能,这个没错,可是我们所用的方法和基组不见得都和高斯中的例子一样,所以会在输出文件中出现E(RB+HF-LYP)等其他一些表示,其实这两种表示都表示单点能只是由于所用的方法和基组不同,还有一个找单点能最好的方法就是在输出文件最后的总结中找HF=xxxx。这个也是单点能。另外大家要注意找单点能时,一定要找最后一次优化时的E(RHF)或者E(RB+HF-LYP)。
这些问题虽然看起来很简单,但是对于我们这些green hands来说感到丈二和尚摸不着头脑,希望这点浅显说明对和我一样的新手有用。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
★ ★ ★ ★ ★
yjcmwgk(金币+5):感谢sob专家的指点,俺受教了 2010-03-23 13:33
不管计算结果列出那么高精度有没有意义,但不能说他错,作者如实报道数据没有问题,因此而对作者发难我觉得不合适。列出多少位数据是在数值精度满足的前提下,根据文章研究内容而定,这没有约定俗成的规定。如果以方法在当前人们观念中的准确度为基准,这太含糊,主观性太强,而且有时代性因素,同一方法在前人和后人看来准确度也不同。AM1列出四位小数,我当年的导师发过的一篇关于抗冻蛋白的计算还恰好就这么做,虽然现在看来列出最后几位没什么意义,但我不认为他不知道半经验方法的局限性,他量化造诣极深。
16楼2010-03-22 23:15:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 20 个回答

3867826

木虫 (著名写手)


把你的OPT命令里面OPT关键字删了算 就是做单点
2楼2010-03-19 16:29:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

vigaryang

木虫 (正式写手)


有个问题:当我采用opt得到一个优化构型之后,再以该构型为初始构型计算freq的时候,为什么在计算频率一开始计算得到的单点能和之前opt输出文件最后给出的构型能量不一致?
3楼2010-03-19 18:14:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhaoxia2501

金虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by vigaryang at 2010-03-19 18:14:37:
有个问题:当我采用opt得到一个优化构型之后,再以该构型为初始构型计算freq的时候,为什么在计算频率一开始计算得到的单点能和之前opt输出文件最后给出的构型能量不一致?

差别很大吗?我一般优化和频率计算一起做的
4楼2010-03-19 19:56:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
☆ 无星级 ★ 一星级 ★★★ 三星级 ★★★★★ 五星级
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +6 yuleib84 2026-08-26 7/350 2026-08-31 19:46 by 鱼翔浅底1
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +17 爱看书的可乐 2026-08-26 19/950 2026-08-31 11:51 by xiangy672
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +6 雨打竹帘 2026-08-30 10/500 2026-08-31 09:29 by huixian257
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +12 Kittylucky 2026-08-27 13/650 2026-08-29 00:04 by superceng
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
信息提示
请填处理意见