24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知(长期有效)
查看: 2363  |  回复: 19
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zhaoxia2501

金虫 (小有名气)


[资源] 【分享】单点能

这几天写文章遇到一个单点能问题,向同学请教了才搞清楚,很多人都讲在输出文件中E(RHF)代表单点能,这个没错,可是我们所用的方法和基组不见得都和高斯中的例子一样,所以会在输出文件中出现E(RB+HF-LYP)等其他一些表示,其实这两种表示都表示单点能只是由于所用的方法和基组不同,还有一个找单点能最好的方法就是在输出文件最后的总结中找HF=xxxx。这个也是单点能。另外大家要注意找单点能时,一定要找最后一次优化时的E(RHF)或者E(RB+HF-LYP)。
这些问题虽然看起来很简单,但是对于我们这些green hands来说感到丈二和尚摸不着头脑,希望这点浅显说明对和我一样的新手有用。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
引用回帖:
Originally posted by sobereva at 2010-03-20 23:06:00:
一定要把方法的准确度和数值计算精度两个概念分清。

迭代过程的收敛限小于小数点后几位,列出几位从原则上就没有问题,至于实际列出几位,与研究的问题有关。例如几何优化,高斯的tight收敛限之一是原子最大位 ...

但是,sob专家,如果我用am1算了一个C-C键,然后我说这个键长为1.5679埃,不论是否加上了verytight,这恐怕仍旧不合适吧……

如果某人用am1算了一个C-C键,然后说这个键长为1.5679埃,很明显意味着他不知道am1的准确度呀。

小卒很敬仰sob专家,但是小卒却不得不说:抛开方法的准确度,空洞的谈论scf的准确度,恐怕没意义呢?您说呢sob专家?

总之如果让小卒来做am1计算,小卒可从来都会加上scf(conver=3或4)的sob专家您看,如果小卒写这么个命令# am1 opt scf(conver=7),您看是不是很不可思议?

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-3-22 at 14:07 ]
15楼2010-03-22 14:00:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 20 个回答

3867826

木虫 (著名写手)


把你的OPT命令里面OPT关键字删了算 就是做单点
2楼2010-03-19 16:29:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

vigaryang

木虫 (正式写手)


有个问题:当我采用opt得到一个优化构型之后,再以该构型为初始构型计算freq的时候,为什么在计算频率一开始计算得到的单点能和之前opt输出文件最后给出的构型能量不一致?
3楼2010-03-19 18:14:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhaoxia2501

金虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by vigaryang at 2010-03-19 18:14:37:
有个问题:当我采用opt得到一个优化构型之后,再以该构型为初始构型计算freq的时候,为什么在计算频率一开始计算得到的单点能和之前opt输出文件最后给出的构型能量不一致?

差别很大吗?我一般优化和频率计算一起做的
4楼2010-03-19 19:56:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
☆ 无星级 ★ 一星级 ★★★ 三星级 ★★★★★ 五星级
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见