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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【分享】单点能
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zhaoxia2501

金虫 (小有名气)

[资源] 【分享】单点能

这几天写文章遇到一个单点能问题，向同学请教了才搞清楚，很多人都讲在输出文件中E(RHF)代表单点能，这个没错，可是我们所用的方法和基组不见得都和高斯中的例子一样，所以会在输出文件中出现E(RB+HF-LYP)等其他一些表示，其实这两种表示都表示单点能只是由于所用的方法和基组不同，还有一个找单点能最好的方法就是在输出文件最后的总结中找HF=xxxx。这个也是单点能。另外大家要注意找单点能时，一定要找最后一次优化时的E(RHF)或者E(RB+HF-LYP)。
这些问题虽然看起来很简单，但是对于我们这些green hands来说感到丈二和尚摸不着头脑，希望这点浅显说明对和我一样的新手有用。
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1楼 2010-03-19 16:15:02
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)
★ ★ ★
erylingjet(金币+3): 2010-04-01 17:58
引用回帖:
Originally posted by vigaryang at 2010-03-20 08:48:32:

不一定，一般是相差小数点后第七位。虽然不是很大，但按理说对于同一个构型，gaussian的计算应该是能完全重复的啊，咋会有差别呢。

以au作为单位，如果你的计算水平是b3lyp/6-31g(d)，采用默认收敛标准的话，那么对于opt的E来说，小数点后第6位就不可信了。对于单点计算的E来说，小数点后第5位就已经不可信了。
一定要注意不同计算方法的有效数字问题

记得有次审稿，有个家伙用b3lyp/6-31g*算东西，给出的能级（单位eV）是保留三位小数，键长（单位埃）保留三位小数，键角（单位度）保留两位小数。我忍了很久，没给他提出这个问题来，让他过了。其实我很想灭他

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-3-20 at 10:58 ]
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8楼2010-03-20 10:54:28
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)
引用回帖:
Originally posted by qzhaosdu at 2010-03-20 15:09:30:
版主大人。。。这个保留几位有效数字的问题也要看你是算的什么东西吧，不能以偏概全吧。。

赵大人说得对，呵呵。
算CHON体系，B3lyp/6-31g*算的构型，精确度还真能达到小数点后三位。不过算轻过渡金属和短周期非金属元素的配合物，恐怕只能达到小数点后两位了。如果算重过渡金属和短周期非金属元素的配合物，恐怕只能达到小数点后1位了。（单位nm）
赵大人给咱们版做专家顾问吧，行吗？
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12楼2010-03-20 18:38:08
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)
引用回帖:
Originally posted by sobereva at 2010-03-20 23:06:00:
一定要把方法的准确度和数值计算精度两个概念分清。

迭代过程的收敛限小于小数点后几位，列出几位从原则上就没有问题，至于实际列出几位，与研究的问题有关。例如几何优化，高斯的tight收敛限之一是原子最大位 ...

但是，sob专家，如果我用am1算了一个C-C键，然后我说这个键长为1.5679埃，不论是否加上了verytight，这恐怕仍旧不合适吧……

如果某人用am1算了一个C-C键，然后说这个键长为1.5679埃，很明显意味着他不知道am1的准确度呀。

小卒很敬仰sob专家，但是小卒却不得不说：抛开方法的准确度，空洞的谈论scf的准确度，恐怕没意义呢？您说呢sob专家？

总之如果让小卒来做am1计算，小卒可从来都会加上scf(conver=3或4)的sob专家您看，如果小卒写这么个命令# am1 opt scf(conver=7)，您看是不是很不可思议？

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-3-22 at 14:07 ]
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15楼2010-03-22 14:00:25
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)
引用回帖:
Originally posted by caohuiming at 2010-03-26 11:18:00:
看了小卒版主和sobereva  的讨论受教很深，但也有疑问。对于小卒的观点——视方法的基组来判断精确度应该取小数点后几位，然后还要考虑体系的影响。我很疑惑，如果真用B3lyp/6-31g*算重过渡金属和短周期非金属元素 ...

呵呵，那我还是灭他。因为这种情况下B3lyp/6-31g*根本不合适嘛……曾经见过一个杂志上，一群人用6-31g*算镧。我很奇怪这个文章居然能被发表。呵呵，不过是个小杂志。

方法和基组的选择经验，小卒在咱们区的区刊Research of Calculation and Simulation, 2010, Vol. 1, No. 1, Page 3-18上有讨论，该文的第二章第七节
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20楼2010-03-29 11:34:50
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