查看: 3424  |  回复: 19
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zhaoxia2501

金虫 (小有名气)


[资源] 【分享】单点能

这几天写文章遇到一个单点能问题,向同学请教了才搞清楚,很多人都讲在输出文件中E(RHF)代表单点能,这个没错,可是我们所用的方法和基组不见得都和高斯中的例子一样,所以会在输出文件中出现E(RB+HF-LYP)等其他一些表示,其实这两种表示都表示单点能只是由于所用的方法和基组不同,还有一个找单点能最好的方法就是在输出文件最后的总结中找HF=xxxx。这个也是单点能。另外大家要注意找单点能时,一定要找最后一次优化时的E(RHF)或者E(RB+HF-LYP)。
这些问题虽然看起来很简单,但是对于我们这些green hands来说感到丈二和尚摸不着头脑,希望这点浅显说明对和我一样的新手有用。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
★ ★ ★ ★ ★
yjcmwgk(金币+5): 2010-03-22 14:01
一定要把方法的准确度和数值计算精度两个概念分清。

迭代过程的收敛限小于小数点后几位,列出几位从原则上就没有问题,至于实际列出几位,与研究的问题有关。例如几何优化,高斯的tight收敛限之一是原子最大位移是0.000060 bohr,那么文章中列出小数点后四位是没有问题的。对于研究一些弱相互作用,距离要写到小数点后五位来减小舍入误差,这时就应当用very tight,若此时仍用tight标准,甚至default标准,数据相当于伪造的。

并不能因为方法可能不准确,而不允许列出某种精度的数据,有效数字只与收敛限(还包括变量类型等因素),而与方法无关。例如半经验方法,计算键长平均误差达到小数点后2位甚至1位(埃),但给出结果时一般仍列出两、三位,这是没有问题的,除非收敛限放得太宽。至于其结果准确不准确,可信不可信,那要靠读者根据经验自行判断。
14楼2010-03-20 23:06:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 20 个回答

3867826

木虫 (著名写手)


把你的OPT命令里面OPT关键字删了算 就是做单点
2楼2010-03-19 16:29:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

vigaryang

木虫 (正式写手)


有个问题:当我采用opt得到一个优化构型之后,再以该构型为初始构型计算freq的时候,为什么在计算频率一开始计算得到的单点能和之前opt输出文件最后给出的构型能量不一致?
3楼2010-03-19 18:14:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhaoxia2501

金虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by vigaryang at 2010-03-19 18:14:37:
有个问题:当我采用opt得到一个优化构型之后,再以该构型为初始构型计算freq的时候,为什么在计算频率一开始计算得到的单点能和之前opt输出文件最后给出的构型能量不一致?

差别很大吗?我一般优化和频率计算一起做的
4楼2010-03-19 19:56:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
☆ 无星级 ★ 一星级 ★★★ 三星级 ★★★★★ 五星级
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了,离AI做有机合成还有多远? +8 wangyl_123 2026-10-10 12/600 2026-10-13 20:40 by Merryya
[硕博家园] 极限拉扯,如何抉择 +9 Isak0320 2026-10-12 13/650 2026-10-13 11:57 by Isak0320
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么? +4 好运来~9527 2026-10-10 7/350 2026-10-13 08:41 by xli1984
[基金申请] 入职后第一次管课题组的专利缴费,对账才发现官费比别人多掏了一倍 +6 13108017953 2026-10-08 6/300 2026-10-12 20:07 by w3w3y3
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[教师之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷!
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
[有机交流] 各位大佬,路线设计求助 +6 zapen 2026-10-08 8/400 2026-10-10 15:59 by zapen
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些? +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
请填处理意见