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seelem

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】测定萜类合酶TPS的一种生化实验方法,大家看看是否可行?

萜类合成酶是萜类化合物生物合成过程中的关键酶之一。分别催化前体底物GPP、FPP、和GGPP,形成单萜、倍半萜和二萜。大多数萜类合成酶都是可溶性的酸性蛋白,天然分子质量在35~80 ku之间,其催化反应依赖2价金属阳离子(如Mg2+,Mn2+,Fe2+等),萜烯合成酶根据其功能可以分为3大类,分别是单萜合成酶、倍半萜合成酶和二萜合成酶。其中单萜合成酶的等电点值大约在pH 6左右,其最佳pH范围在6.8~7.8之间。通常裸子植物的萜烯合成酶要比被子植物的萜烯合成酶偏高些,最适pH值偏碱性。裸子植物单萜合成酶的催化作用不仅依赖2价金属离子(但更偏好Mn2+),而且还需要单价阳离子(如K+)来激活,该特性是被子植物单萜合成酶所不具有的。

1 蛋白质的提取
每次从4棵油松树苗取相似部位的木质部组织样本(材料组织共10g)作为一个蛋白提取点,使用液氮分析磨研磨。研磨后加入缓冲液。
缓冲液配方:
50 mM MOPSO,pH 6.8;
5 mM 抗坏血酸;
5 mM NaHSO3;
5 mM 二硫苏糖醇(DTT);
10 mM MgCl2;
1 mM EDTA;
10% [v/v] 甘油;
1% [w/v]  (PVP)聚乙烯吡咯烷酮 [Mr 10,000];
4% [w/v]  (PVPP) 聚乙烯聚吡咯烷酮;
4% [w/v] amberlite XAD-4;苯酚甲醛离子交换树脂
0.1% [v/v] Tween 20
比率1:10  (g tissue : mL buffer).

缓冲液的温度保持4°C,震荡30 min,然后低温离心10,000 g, 30 min。取上层液用两层 No. 1 filter paper过滤,4ml 分装,-80℃ 低温保存(液氮或低温冰箱)。

2 萜类合酶分析
TPS Enzyme Assays
37℃解冻蛋白质提取液,加入萜合酶缓冲液:mono-TPS buffer(25 mm HEPES羟乙基哌嗪乙磺酸, pH 7.5; 5 mm DTT; 10%[v/v] 甘油; 1 mm MnCl2; and 100 mm KCl),sesqui-TPS buffer (25 mm HEPES, pH 7.3; 10 mm MgCl2; 10 mm DTT; and 10% [v/v] glycerol), or di-TPS buffer (30 mm HEPES, pH 7.2; 7.5 mm MgCl2; 20 m MnCl2; 5% [v/v]glycerol; and 5 mm DTT).
取1ml对酶活性进行测定,加入底物10 uM (with 1 u Ci 3H-GPP) for mono-TPS activities, or 10 um GGPP (0.5 uCi 3H-GGPP) as substrate for di-TPS assays. 所有的测定都设置重复,加入1 ml戊烷混合收集挥发物质,30℃静置1.5 h,迅速冷冻终止酶活,解冻后涡旋混合,2500转离心2 min,用0.4 g硅胶过滤,与0.6 g硫酸镁混合,去除非目标水解产物,GC-MS分析。

这个方法是国外做大冷杉和挪威云杉的方法,暂不知道国内现在谁做过,请各位虫虫提提意见,谢谢啦!

[ Last edited by seelem on 2010-3-19 at 17:04 ]
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