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美丽的乔

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】关于checkcifA类问题求助已有1人参与

这是我第一次check,有好多都不懂,希望高手们多多耐心指教,我先谢谢大家啦
A类错误如下:
1、Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) ....... OW2
2、A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) ....... OW1
3、 Check Reported Molecular Weight ................ 162.88
4、 Mu(calc) and Mu(CIF) Ratio Differs from 1.0 by . 68.47 Perc.
5、A (Proper) Absorption Correction Method Missing .. ?
6、A Minimum Crystal Dimension Missing (or Error) ... ?
7、A Medium Crystal Dimension Missing (or Error) ... ?
8、A Maximum Crystal Dimension Missing (or Error) ... ?
9、A No H-atoms, but _solution_hydrogens reported as geom
10、A No H-atoms, but _hydrogen_treatment reported as mixed
11、A No _symmetry_space_group_name_H-M Given ........ ?
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)


美丽的乔(金币+1): 2010-04-02 10:43
wsht212(金币+1):谢谢交流,希望常来! 2010-05-09 14:45:50
引用回帖:
Originally posted by 美丽的乔 at 2010-03-23 15:19:16:




我的pcf文件里只有晶系和空间群,没有晶体的尺寸,该怎么办啊

你在收晶体之前就应该输入晶体的尺寸啊,你要是还保留这晶体的话,不妨放上去在看一下就好了
学无止境
11楼2010-04-02 02:22:43
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244073931

至尊木虫 (著名写手)

美丽的乔(金币+10):谢谢你,能不能介绍一下H2O加氢的过程,多谢啦,要是你能帮我解决A类错误,30个都给你啦,不够还可以再加,我的QQ:979127952,多谢啦 2010-03-18 16:33
1. OW2没有加氢(H2O)
2.OW1没有加氢(H2O)
3.分子量问题,CIF中给出的和实际晶胞中的不一致造成的,在INS文件中改正
4.吸收系数也是3中的原因造成de
5.在CIF文件的Absorption Correction Method 填上如multi-scan
678 填上晶体的尺寸(按大小长宽高各多少)
9 10 吧cif文件中的加氢mixed改为constr
11.填上晶系和空间群
这是OK
2楼2010-03-18 16:11:52
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美丽的乔

木虫 (正式写手)

你好,244073931  ,不方便的话也可以在这上面把加氢的简单操作告诉我,麻烦你了
3楼2010-03-18 16:43:11
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hcht2006

银虫 (正式写手)

美丽的乔(金币+10):谢谢你,我再试试 2010-03-19 09:48
1、傅里叶加氢:把ins中PLAN值改为50或者更大,精修一次以后,仔细寻找氧原子周围较大的Q峰,再根据氢键的方向,把相应的Q定为氢以后,在ins中加入指令
DFIX 0.85 0.01 O1W H11 O1W H12
DFIX 1.39 0.01 H11 H12
精修即可。


2、理论加氢:在XP中输入FMOL,然后回车,输入join O1W 再加一个母体原子
这样就将氧原子和其他原子强行连接起来,然后输入HADD 3 O1W
FILE 保存即可,产生S.ins文件,将其中的三个氢考入res文件,再根据氢的方向杀掉一个,保存,精修即可。
世人笑我太疯癫,我笑他人看不穿。
4楼2010-03-18 21:30:47
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