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【求助】关于checkcifA类问题求助 已有1人参与
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这是我第一次check,有好多都不懂，希望高手们多多耐心指教，我先谢谢大家啦 A类错误如下： 1、Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) ....... OW2 2、A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) ....... OW1 3、 Check Reported Molecular Weight ................ 162.88 4、 Mu(calc) and Mu(CIF) Ratio Differs from 1.0 by . 68.47 Perc. 5、A (Proper) Absorption Correction Method Missing .. ? 6、A Minimum Crystal Dimension Missing (or Error) ... ? 7、A Medium Crystal Dimension Missing (or Error) ... ? 8、A Maximum Crystal Dimension Missing (or Error) ... ? 9、A No H-atoms, but _solution_hydrogens reported as geom 10、A No H-atoms, but _hydrogen_treatment reported as mixed 11、A No _symmetry_space_group_name_H-M Given ........ ? |
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美丽的乔(金币+10):谢谢你，能不能介绍一下H2O加氢的过程，多谢啦，要是你能帮我解决A类错误，30个都给你啦，不够还可以再加，我的QQ:979127952,多谢啦 2010-03-18 16:33
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1. OW2没有加氢（H2O） 2.OW1没有加氢（H2O） 3.分子量问题，CIF中给出的和实际晶胞中的不一致造成的，在INS文件中改正 4.吸收系数也是3中的原因造成de 5.在CIF文件的Absorption Correction Method 填上如multi-scan 678 填上晶体的尺寸（按大小长宽高各多少） 9 10 吧cif文件中的加氢mixed改为constr 11.填上晶系和空间群 这是OK |
2楼2010-03-18 16:11:52
3楼2010-03-18 16:43:11
美丽的乔(金币+10):谢谢你，我再试试 2010-03-19 09:48
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1、傅里叶加氢：把ins中PLAN值改为50或者更大，精修一次以后，仔细寻找氧原子周围较大的Q峰，再根据氢键的方向，把相应的Q定为氢以后，在ins中加入指令 DFIX 0.85 0.01 O1W H11 O1W H12 DFIX 1.39 0.01 H11 H12 精修即可。 2、理论加氢：在XP中输入FMOL,然后回车，输入join O1W 再加一个母体原子 这样就将氧原子和其他原子强行连接起来，然后输入HADD 3 O1W FILE 保存即可，产生S.ins文件，将其中的三个氢考入res文件，再根据氢的方向杀掉一个，保存，精修即可。 |
4楼2010-03-18 21:30:47
5楼2010-03-18 21:44:54
6楼2010-03-19 10:31:15
7楼2010-03-19 10:32:39
8楼2010-03-23 14:35:03
9楼2010-03-23 15:19:16
10楼2010-03-31 21:14:19
