24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 294  |  回复: 2
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 微笑漩涡 的 4 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

微笑漩涡

新虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】做过TAIL-PCR的大侠帮忙哈

最近做兼并PCR获得一个约500bp的核酸片段,想通过TAIL-PCR获得全长。

但是不知道在这个PCR中   低退火温度的随机引物(AD)如何设计。

我的基因组是宏基因组,不能确定物种。

劳烦做过的大侠回答。谢谢
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gastrodia

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
1949stone(金币+3): 2010-03-06 20:48
不好意思,我误导你了,我做的时候就是用刘的那个随机引物,但是换其他物种不一定能够做出来,
可以根据已知序列设计3 个与其边界距离不等的嵌套的特异性引物,特异性引物的长度约20 bp , Tm 一般为58~68 ℃。再按照物种普遍存在的蛋白质的保守氨基酸序列设计一系列简并引物,简并引物相对较短,长度为14 bp , Tm 为30~48 ℃。

兼并引物你会设计吧,用你要扩增的物种的近缘物种的蛋白质序列进行blast,找出保守序列,用primer primer5.0把保守的氨基酸反过来翻译成核酸的兼并序列,

获得侧翼序列除了tail-PCR还有genome walking(就是酶切之后加接头的那种)
3楼2010-03-06 20:35:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 3 个回答

gastrodia

金虫 (正式写手)

微笑漩涡(金币+1):不是和物种的碱基使用频率有关么?大侠你做的时候是用的刘的那个随机引物么 2010-03-06 10:49
随机引物AD1 AD2 AD3不需要自己设计,参考tail-PCR的最初文献即可,需要你设计的引物是特异性的嵌套引物
2楼2010-03-06 09:52:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 290调剂生物0860 +34 哇哈哈,。 2026-04-11 40/2000 2026-04-14 20:45 by xiaoyidao129
[考研] 273求调剂 +4 白居不易. 2026-04-09 6/300 2026-04-14 19:54 by 逆水乘风
[考研] 求调剂 +9 小聂爱学习 2026-04-11 13/650 2026-04-14 19:18 by Art1977
[考研] 考研求调剂 +6 ban班小七 2026-04-11 6/300 2026-04-14 14:06 by 哆啦A梦只是个梦
[考研] 085408光电信息工程专硕355一志愿长春光机所调剂 +6 王ymaa 2026-04-13 13/650 2026-04-14 11:33 by 王ymaa
[考研] 300分求调剂 (085501机械专硕,本科扬大) +9 xu@841019 2026-04-11 10/500 2026-04-14 08:48 by 木木mumu~
[考研] 2026硕士调剂_能动_河南农业大学 +4 河南农业大学-能 2026-04-12 4/200 2026-04-13 22:01 by bljnqdcc
[基金申请] 有爆料,一个青年教师卖房得400万,然后换了一个四青帽子 +11 babu2015 2026-04-08 11/550 2026-04-13 16:33 by probebill
[考研] 本科南方医科大学 一志愿985 药学学硕284分 求调剂 +5 弱水听文 2026-04-09 5/250 2026-04-12 13:16 by shengxi123
[考研] 280求调剂 +13 wzzz王 2026-04-09 13/650 2026-04-12 00:31 by 勇攀高峰0126
[考研] 0860004 求调剂 309分 +9 Yin DY 2026-04-08 9/450 2026-04-11 22:55 by dongdian1
[考研] 求调剂 +6 电气300求调剂不 2026-04-08 6/300 2026-04-11 20:14 by 逆水乘风
[考研] 农学0904 312求调剂 +6 Say Never 2026-04-10 6/300 2026-04-11 10:33 by wwj2530616
[考研] 22408 327分求调剂 +4 韵风kon 2026-04-10 4/200 2026-04-11 09:51 by 猪会飞
[考研] 342电子信息专硕求调剂 +9 你让我怎么荔枝 2026-04-10 10/500 2026-04-11 08:33 by zhq0425
[考研] 一志愿北理工298英一数二已上岸,感谢各位老师 +14 Reframe 2026-04-10 16/800 2026-04-10 23:07 by caotw2020
[考博] 博士自荐 +7 可可小胖 2026-04-08 7/350 2026-04-10 08:28 by kimhero
[考研] 348求调剂 +3 candyyyi 2026-04-09 3/150 2026-04-09 17:20 by 段伟艳
[考研] 283电子信息求调剂 +4 三石WL 2026-04-08 4/200 2026-04-09 10:21 by wp06
[考研] 考研求调剂 +4 雯??? 2026-04-08 4/200 2026-04-08 21:44 by 土木硕士招生
信息提示
请填处理意见