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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】如何设计同源引物？
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【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 yghboy168 的 9 个金币

yghboy168

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】如何设计同源引物？

我做的链霉菌没有测序，现在要克隆基因出来，需要设计同源引物。这方面没有做过。请教大家。只知道需要先对比序列，找出同源序列，对同源序列，设计引物。用什么软件对比啊？如果同源序列只在基因的中间，如何克隆出全基因？同源性达到什么程度才可以设计同源引物？同源性不强怎么办？
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眼内有尘三界窄，心头无事一床宽！
1楼 2010-03-03 16:28:25
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your2007

至尊木虫 (著名写手)
有筛选模型就建文库调基因出来，
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爱人者被爱，敬人者人敬
2楼2010-03-03 19:14:27
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yujiaping1

木虫 (著名写手)
★
yghboy168(金币+1): 2010-03-03 20:54
1949stone(金币+1): 2010-03-03 23:32
用Blast比对软件，很多的，在NCBI网站上直接比对比较好
找到序列后，设计RACE引物获得全长，是以RNA合成供两端RACE PCR的cDNA为模板
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3楼2010-03-03 19:19:44
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yghboy168

银虫 (小有名气)
★ ★
amisking(金币+2): 2010-03-03 21:28
我的意思是，比如知道同属其他菌种的葡萄糖激酶基因序列，通过同源性对比来，找到这个基因的保守区域，而设计同源引物来克隆出，我所研究菌的基因。我只是知道基本原理，没有做过细节不太清楚。呵呵希望有经验的大侠指教
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眼内有尘三界窄，心头无事一床宽！
4楼2010-03-03 20:53:50
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chenyuqin

新虫 (小有名气)
NCBI上Blast比对找出同源区域，可以设计兼并引物，然后设计RACE引物获得全长
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where there is a will,there ia a way.
5楼2010-03-03 21:19:09
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