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CADD

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助完结】用Surflex做docking时出错

(我用的对接软件是Surflex,在sybyl上做对接)

1. 开始做docking时,score的值不好,一次对接了二十几个化合物,但是score的值
最大只有零点几。后来先用FieldTemplate和FieldAlign两个软件处理了一下,发现
score的值好了很多。我这样做,会不会影响对接的结果那?


2. 用FieldTemplate和FieldAlign两个软件处理后,发现score的值最高的化合物,它的药理活性值并不好,这就和实际产生了差异。做到这里我不知道该怎么做了。

3. 用Surflex做对接时一次最多可多少个化合物同时对接?

希望大家指点一下。

[ Last edited by CADD on 2010-3-8 at 15:19 ]
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mike0601

木虫 (正式写手)

★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-03-11 09:13
CADD(金币+4):谢谢回帖。 2010-03-11 15:17
对于你的第三个问题  你可以在对接时选择sybyl database  这样你数据库里的所有分子可以一次性的进行对接
2楼2010-03-11 00:11:45
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