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银虫 (正式写手)

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[交流] 【求助完结】用Surflex做docking时出错

（我用的对接软件是Surflex,在sybyl上做对接）

1. 开始做docking时，score的值不好，一次对接了二十几个化合物，但是score的值
最大只有零点几。后来先用FieldTemplate和FieldAlign两个软件处理了一下，发现
score的值好了很多。我这样做，会不会影响对接的结果那？

2. 用FieldTemplate和FieldAlign两个软件处理后，发现score的值最高的化合物，它的药理活性值并不好，这就和实际产生了差异。做到这里我不知道该怎么做了。

3. 用Surflex做对接时一次最多可多少个化合物同时对接？

希望大家指点一下。

[ Last edited by CADD on 2010-3-8 at 15:19 ]

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1楼 2010-03-01 11:02:13

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mike0601

木虫 (正式写手)

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ghcacj(金币+2):谢谢 2010-03-11 09:13
CADD(金币+4):谢谢回帖。 2010-03-11 15:17

对于你的第三个问题你可以在对接时选择sybyl database 这样你数据库里的所有分子可以一次性的进行对接

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2楼2010-03-11 00:11:45

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