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【求助】虫友们，我想模拟一个肽链的三维结构，如何实现呀，急盼回复。
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虫友们，我想模拟一个肽链（十几个氨基酸组成）的三维结构，如何实现呀。 用什么软件，有免费的吗，从没接触过CADD的我能搞定不？希望专业的虫友多多指教！谢谢！ |
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3楼2010-03-01 14:20:50
bay__gulf
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+4):谢谢 2010-03-01 11:10
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+4):谢谢 2010-03-01 11:10
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针对不同的蛋白结构,有不同的模拟方法,大致可以按照如下思路 如果有类似的天然蛋白结构,可以用同源建模的方法 如果没有,但分子较小时候,可以用动力学模拟和从头计算方法 你的体系用第二种不错, 软件可以使用gmx 或namd 具体方法参考 http://www.ks.uiuc.edu/Research/folding/ |
2楼2010-03-01 09:29:20
bay__gulf
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4楼2010-03-01 15:04:15
5楼2010-03-02 21:50:28