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yucheng9255木虫 (著名写手)
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[交流]
【专题】希望大家对我的实验思路提出宝贵意见
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老板让我研究野生葡萄中的ALDH基因的表达和功能性分析,该葡萄品种中ALDH基因还没人研究过, 以下是我的实验思路: 1) 通过生物信息学查找所有生物中的ALDH 基因,找出保守序列 2) 通过保守序列设计引物,使用PCR的方法,克隆出一个片段,测序。 3) 根据所克隆片段的序列设计引物,通过RACE的方法,得出序列的3 和5 末端,从而得出ALDH的全长,测序 4) 用RT-PCR的方法,研究ALDH基因在不同组织和时间的表达情况 5) 制备ALDH多克隆抗体,进行Western,验证ALDH酶的在不同时间和组织的表达情况 6) 在逆境条件下,RT-RCR和western 的方法,对ALDH基因和ALDH酶 在不同组织和不同时间的表达情况进行研究 7) 对ALDH进行功能性研究 这种思路正确吗?还有怎么查出所有的ALDH基因?如何找出它们的保守序列?怎么对酶进行功能性研究?希望大家提出宝贵的意见! 谢谢!!! |
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yucheng9255(金币+5):真是谢谢了 2010-02-09 17:31
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1) 通过生物信息学查找所有生物中的ALDH 基因,找出保守序列 其实没有必要找所有物种的啦,相近的就可以了,毕竟主要目的就是先得到一段序列 2) 通过保守序列设计引物,使用PCR的方法,克隆出一个片段,测序。 最好用RT-pcr啦,转录本水平做 3) 根据所克隆片段的序列设计引物,通过RACE的方法,得出序列的3 和5 末端,从而得出ALDH的全长,测序 4) 用RT-PCR的方法,研究ALDH基因在不同组织和时间的表达情况 Qpcr 5) 制备ALDH多克隆抗体,进行Western,验证ALDH酶的在不同时间和组织的表达情况 是表达蛋白还是用多肽做? 表达蛋白的话,又要增加一个步骤了。。。 6) 在逆境条件下,RT-RCR和western 的方法,对ALDH基因和ALDH酶 在不同组织和不同时间的表达情况进行研究 7) 对ALDH进行功能性研究 这一套做下来,,,,好几年过去了 |
4楼2010-02-09 16:49:06
3楼2010-02-09 16:41:56
yucheng9255
木虫 (著名写手)
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