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yucheng9255

木虫 (著名写手)

[交流] 【转帖】请问两个同源性较高的基因,怎么通过RT-PCR研究各自的表达情况

我要研究葡萄中ALDH2a 和ALDH2b基因各自在葡萄个组织的表达情况,但是二者的同源性相当高,怎么设计引物能通过RT-PCR来研究二者基因各自的表达情况呢?
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cofe

金虫 (小有名气)

yucheng9255(金币+1):谢谢 2010-02-08 20:17
可以找ORF前段或后端UTR区域设计引物。
2楼2010-02-08 11:57:24
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yangym1123

木虫 (小有名气)

★ ★ ★
amisking(金币+3): 2010-02-08 12:24
yucheng9255(金币+1): 2010-02-08 20:17
yucheng9255(金币+1):谢谢 2010-02-08 20:18
同源性高应该指的是编码区吧?可以在非编码区域(3' 5'UTR区域)设计特异引物进行定量或半定量检测。一般情况下基因的非编码区不保守,以前也做过这方面的实验,只能考虑非保守区把这两个基因区分开来!祝你好运!
3楼2010-02-08 12:06:48
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cyjwx123

铁虫 (小有名气)

yucheng9255(金币+1):谢谢 2010-02-08 20:17
同源性应该是指的是基因表达后的蛋白具有很高的相似性吧。反推过去的话,即2个基因的ORF基本上相同,所以建议你设计引物的话在UTR区域设计会比较好~~
看的开才是真本事~
4楼2010-02-08 13:23:02
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cyjwx123

铁虫 (小有名气)

yucheng9255(金币+1):1 2010-02-08 20:18
还有就是表达量的大小似乎要做real-PCR吧?
看的开才是真本事~
5楼2010-02-08 13:27:06
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松上云雀

木虫 (正式写手)


yucheng9255(金币+1):谢谢参与
跑过来学习下,顺便顶下帖子!
6楼2010-02-09 11:58:10
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anny66cb

银虫 (小有名气)


yucheng9255(金币+1):谢谢参与
应该是UTR区设计引物
7楼2010-02-09 12:17:14
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1110rainjob

铜虫 (小有名气)


yucheng9255(金币+1):谢谢参与
同源性高,但是也肯定有存在差异的部分,可以尝试针对差异的部分设计引物扩增
8楼2010-02-09 12:38:59
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刘仕博

金虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我也有一样的问题。
一般不是不可以在UTR区设计引物的吗?
之前我做过一个基因,和它同源的基因和这个基因的相似率90%多。我自己比较了下这两个基因的序列,就只有几个碱基是不一样的,最后实在没有办法,我就放弃了。
生命在于折腾~
9楼2010-02-09 17:10:24
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xiao精灵

金虫 (小有名气)

嗯,8错8错~~
10楼2010-03-11 22:39:33
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