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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【转帖】请问两个同源性较高的基因，怎么通过RT-PCR研究各自的表达情况
汕头大学海洋科学接受调剂
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yucheng9255

木虫 (著名写手)

[交流] 【转帖】请问两个同源性较高的基因，怎么通过RT-PCR研究各自的表达情况

我要研究葡萄中ALDH2a 和ALDH2b基因各自在葡萄个组织的表达情况，但是二者的同源性相当高，怎么设计引物能通过RT-PCR来研究二者基因各自的表达情况呢？
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1楼 2010-02-08 10:43:43
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cofe

金虫 (小有名气)
yucheng9255(金币+1):谢谢 2010-02-08 20:17
可以找ORF前段或后端UTR区域设计引物。
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2楼2010-02-08 11:57:24
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yangym1123

木虫 (小有名气)
★ ★ ★
amisking(金币+3): 2010-02-08 12:24
yucheng9255(金币+1): 2010-02-08 20:17
yucheng9255(金币+1):谢谢 2010-02-08 20:18
同源性高应该指的是编码区吧？可以在非编码区域（3' 5'UTR区域）设计特异引物进行定量或半定量检测。一般情况下基因的非编码区不保守，以前也做过这方面的实验，只能考虑非保守区把这两个基因区分开来！祝你好运！
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3楼2010-02-08 12:06:48
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cyjwx123

铁虫 (小有名气)
yucheng9255(金币+1):谢谢 2010-02-08 20:17
同源性应该是指的是基因表达后的蛋白具有很高的相似性吧。反推过去的话，即2个基因的ORF基本上相同，所以建议你设计引物的话在UTR区域设计会比较好~~
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看的开才是真本事~
4楼2010-02-08 13:23:02
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cyjwx123

铁虫 (小有名气)
yucheng9255(金币+1):1 2010-02-08 20:18
还有就是表达量的大小似乎要做real-PCR吧？
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看的开才是真本事~
5楼2010-02-08 13:27:06
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松上云雀

木虫 (正式写手)
★
yucheng9255(金币+1):谢谢参与
跑过来学习下，顺便顶下帖子！
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6楼2010-02-09 11:58:10
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anny66cb

银虫 (小有名气)
★
yucheng9255(金币+1):谢谢参与
应该是UTR区设计引物
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7楼2010-02-09 12:17:14
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1110rainjob

铜虫 (小有名气)
★
yucheng9255(金币+1):谢谢参与
同源性高，但是也肯定有存在差异的部分，可以尝试针对差异的部分设计引物扩增
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8楼2010-02-09 12:38:59
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刘仕博

金虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我也有一样的问题。
一般不是不可以在UTR区设计引物的吗？
之前我做过一个基因，和它同源的基因和这个基因的相似率90%多。我自己比较了下这两个基因的序列，就只有几个碱基是不一样的，最后实在没有办法，我就放弃了。
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生命在于折腾~
9楼2010-02-09 17:10:24
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xiao精灵

金虫 (小有名气)
嗯，8错8错~~
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10楼2010-03-11 22:39:33
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