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beefly

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地沟油冶炼专家

[交流] 【讨论】奇怪的铍-氧键级 已有1人参与

对常规化合物来说,各种不同的键级计算方法,尽管数值不同,但一般都会给出定性相同的结果。但Be-O键确是例外。

做这样一个计算:b3lyp/6-311++g**,Be-O键长取实验值1.331 Angstrom。Gaussian输入:

# b3lyp/6-311++g** 6d pop=nboread aim=bo iop(6/80=1) fchk

test

0 1
Be
O 1 1.331

$nbo bndidx $end


先看Be原子所带电荷。Mulliken电荷为0.451,这个靠不住,不用管它。AIM电荷是1.531;NBO电荷1.599;用“分子中的原子轨道”(AOIM)方法,电荷1.794。都标明Be原子失去将近两个电子给O原子。因此Be-O应当是双键。

再看键级:

Mayer键级:2.310
AIM键级:0.910
NBO键级(Wiberg):0.750
AOIM键级:0.367

Mayer键级显示Be-O是双键,符合经验的键级以及上面的电荷分析。AIM和NBO则支持单键。如果用AOIM方法,则连单键都算不上。

换用其它电子密度(HF,MP2,CCSD)和基组,会得到类似的结果。

这是不是说明,在四种键级计算方法中,最简单的Mayer键级反而是最可靠的呢?


AOIM分析用AOIM程序完成。
http://faculty.sxu.cn/luhg/aoim.html

[ Last edited by beefly on 2010-2-6 at 05:16 ]
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sobereva

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yjcmwgk(金币+5): 2010-02-07 20:44
zhou的观点很有益,最终键级结果有问题,应该能从系数找到答案。又看了下AOIM的输出,注意到这部分:

MO components in correcttectted STOs(>0.05):
MO:   1 E=   -19.05375 A.U.
    1.00   2 O1S
MO:   2 E=    -4.07040 A.U.
    0.99   1Be1S
MO:   3 E=    -0.85187 A.U.
    0.95   2 O2S
MO:   4 E=    -0.30017 A.U.
    0.09   1Be2S
    0.05   2 O2S
    0.86   2 O2Pz
MO:   5 E=    -0.26556 A.U.
    0.99   2 O2Px
MO:   6 E=    -0.26556 A.U.
HOMO
    0.99   2 O2Py

这就是用AOIM波函数投影方法后得到的新的MO展开系数,只列出了大于0.05的部分。原先的MO的第5、6个轨道Be-O的pi键,按照Mayer键级应该约为1。然而以AOIM轨道为基时,这两个pi轨道却完全成了O的孤对电子,Mayer键级为0。所以AOIM的结果与原先的结果之差,即2.31与0.367相减,约等于2,正是这对两个轨道错误的处理引起的。

很有可能AOIM对于这类孤对电子向空轨道配位成pi键的体系都或多或少存在这样的问题。

[ Last edited by sobereva on 2010-2-7 at 20:30 ]
6楼2010-02-07 20:27:51
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llhxaustin

木虫 (著名写手)


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"Be-O键长取实验值1.331 Angstrom",是真空或气相条件的键长,还是晶体中的键长?

研究一下,这个单独的双原子分子如果游离存在时,是不是只有反馈键存在啊?
2楼2010-02-06 07:56:55
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主


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引用回帖:
Originally posted by beefly at 2010-02-06 05:14:02:
对常规化合物来说,各种不同的键级计算方法,尽管数值不同,但一般都会给出定性相同的结果。但Be-O键确是例外。

做这样一个计算:b3lyp/6-311++g**,Be-O键长取实验值1.331 Angstrom。Gaussian输入:

# b3l ...

aoim计算程序是beefly先生的原创?
3楼2010-02-06 12:31:46
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sobereva

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yjcmwgk(金币+4): 2010-02-07 16:17
BeO的AOIM的结果的确很怪。于是尝试计算LiF,果然AOIM的Mayer键级也很怪,接近于0。怀疑是AOIM处理金属这类空的价轨道较多的体系有问题。
当AOIM的键级有问题时,都可以看到AOIM输出的Spilling残余量很大,估计是AOIM的波函数投影的方法在这类体系下不适用。

Mayer键级可靠性高,和经验相符性好,取原始基组的Mayer键级应该较好。
正常情况AOIM的Mayer键级和原始基组下基本相符,好处是一定程度减小了基组敏感性,但是给出差距过大的结果,则不宜采纳,信其结果不如信AOIM方法本身有问题,AOIM原文中检验其计算键级的能力也仅仅用在几种经典化学键上。
4楼2010-02-07 04:00:45
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