24小时热门版块排行榜    

查看: 964  |  回复: 7
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

duanxe1010

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】请教如何在XP的堆积图中只显示形成氢键的氢

请教各位朋友:

    在XP的堆积图,输哪些指令, 可以只显示形成氢键的氢,而不显示没有形成氢键的氢原子。

  或者怎么做才能得到在堆积图中,只有有氢键的氢显示,而不显示没有形成氢键的氢原子。

[ Last edited by duanxe1010 on 2010-2-2 at 15:45 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

forever1706

禁虫 (知名作家)

duanxe1010(金币+5):谢谢,学习了 2010-02-04 10:32
没听说过这个命令啊。不过有个变通的办法,有点麻烦:1。加上所有氢,2。检查哪些氢原子参与氢键形成 3 删掉所有氢 4。重新在xp中加氢,只加参与形成氢键的氢所在的母原子。 5。 再删无用的氢,比如,一个CH3上只有一个氢参与氢键。则需将另外两个删掉。

哈哈,够烦的了。我是懒得干这样的事。一般在platon检查氢键后用Diamond解决。

期待更直接,有效的办法。
3楼2010-02-02 17:13:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

hongyanxu

木虫 (著名写手)

还有这个命令啊!等着学习~~~
在路上路过
2楼2010-02-02 15:21:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fengqian2004

木虫 (著名写手)

duanxe1010(金币+5):谢谢,学习了 2010-02-04 10:33
两个软件各有利弊,画氢键氢键用XP的堆积图要比用Diamond的好解决,直接堆积就可以表达氢键,与氢原子无关,但太弱的氢键必须,一开始不要删氢,画好氢键后用pick命令闪电部分氢,画出的校正起,在iamond的里面要重新设置O-H距离,在画出,且不好找角度 不整洁,反复的添加,删除太麻烦
痛并快乐着
4楼2010-02-03 08:39:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

forever1706

禁虫 (知名作家)

楼上说的对,在Diamond里要根据platon的检查结果设置氢键的构成原子和相应的氢键键长范围,也挺繁的。
5楼2010-02-03 10:20:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见