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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 基础理论 » 【求助】请教如何在XP的堆积图中只显示形成氢键的氢
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duanxe1010

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】请教如何在XP的堆积图中只显示形成氢键的氢

请教各位朋友：

    在XP的堆积图，输哪些指令， 可以只显示形成氢键的氢，而不显示没有形成氢键的氢原子。

  或者怎么做才能得到在堆积图中，只有有氢键的氢显示，而不显示没有形成氢键的氢原子。

[ Last edited by duanxe1010 on 2010-2-2 at 15:45 ]
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1楼 2010-02-02 13:22:18
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hongyanxu

木虫 (著名写手)
还有这个命令啊！等着学习~~~
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在路上路过
2楼2010-02-02 15:21:45
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forever1706

禁虫 (知名作家)
duanxe1010(金币+5):谢谢,学习了 2010-02-04 10:32
没听说过这个命令啊。不过有个变通的办法，有点麻烦：1。加上所有氢，2。检查哪些氢原子参与氢键形成 3 删掉所有氢 4。重新在xp中加氢，只加参与形成氢键的氢所在的母原子。 5。 再删无用的氢，比如，一个CH3上只有一个氢参与氢键。则需将另外两个删掉。

哈哈，够烦的了。我是懒得干这样的事。一般在platon检查氢键后用Diamond解决。

期待更直接，有效的办法。
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3楼2010-02-02 17:13:18
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fengqian2004

木虫 (著名写手)
duanxe1010(金币+5):谢谢,学习了 2010-02-04 10:33
两个软件各有利弊，画氢键氢键用XP的堆积图要比用Diamond的好解决，直接堆积就可以表达氢键，与氢原子无关，但太弱的氢键必须，一开始不要删氢，画好氢键后用pick命令闪电部分氢，画出的校正起，在iamond的里面要重新设置O-H距离，在画出，且不好找角度 不整洁，反复的添加，删除太麻烦
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痛并快乐着
4楼2010-02-03 08:39:36
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forever1706

禁虫 (知名作家)
楼上说的对，在Diamond里要根据platon的检查结果设置氢键的构成原子和相应的氢键键长范围，也挺繁的。
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5楼2010-02-03 10:20:32
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yy0520yy

金虫 (职业作家)
偶觉得的DIamond 更简单点，而且图也漂亮，一家之言。
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6楼2010-02-03 11:19:21
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duanxe1010

银虫 (小有名气)

没能给您赠送金币

引用回帖:
Originally posted by yy0520yy at 2010-02-03 11:19:21:
偶觉得的DIamond 更简单点，而且图也漂亮，一家之言。

没能给您赠送金币，说是我的级别不够，在此谢谢您的回复。
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7楼2010-02-04 10:40:00
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duanxe1010

银虫 (小有名气)

谢谢

引用回帖:
Originally posted by forever1706 at 2010-02-03 10:20:32:
楼上说的对，在Diamond里要根据platon的检查结果设置氢键的构成原子和相应的氢键键长范围，也挺繁的。

谢谢您的回复，对我很有帮助，给您赠送金币未能成功，在此再次感谢。

另外，在XP中输入pick $h 扫描所有氢键，用回车键去掉自己不需要的氢键，用空格键留下有用的，也行。当然在pack前进行此操作最好。也有些费事。
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8楼2010-02-04 10:48:01
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